RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 HRH2P25021 359 aa11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 CXCR2P25025 360 aa11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 RPL10P27635 214 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 PKLRP30613 574 aa11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 SERPINB1P30740 379 aa11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 PIK3CBP42338 1070 aa11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 DIO3P55073 304 aa11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 RACK1P63244 317 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 ABATP80404 500 aa11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 RCAN2Q14206 197 aa11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 FZD2Q14332 565 aa11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 RPS6KA2Q15349 733 aa11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 NR6A1Q15406 480 aa11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 AGKQ53H12 422 aa11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 MED27Q6P2C8 311 aa11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 SCIMPQ6UWF3 145 aa11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 FAM129CQ86XR2 697 aa11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 KIF2BQ8N4N8 673 aa11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 FNDC5Q8NAU1 212 aa11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 PPFIBP2Q8ND30 876 aa11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 OR7G3Q8NG95 312 aa11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 ACPTQ9BZG2 426 aa11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 RHBGQ9H310 441 aa11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 SLC40A1Q9NP59 571 aa11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 PRDM8Q9NQV8 689 aa11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 NMRK1Q9NWW6 199 aa11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 OR6C2Q9NZP2 312 aa11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 MOSPD1Q9UJG1 213 aa11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 NDUFAF1Q9Y375 327 aa11.46□□□□□ -0.57
GGA3-217ENST00000583667 A0A1W2PP18 115 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 FAM234BA2RU67 622 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 PDZK1P1A8MUH7 402 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 H0YHG0 523 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 MGRN1O60291 552 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 NRP2O60462 931 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 SLC22A3O75751 556 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 WNT1P04628 370 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 ITGB2P05107 769 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 SLC2A4P14672 509 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 ITGAXP20702 1163 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 PGM1P36871 562 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 C21orf58P58505 322 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 CLN3Q13286 438 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 IMPG1Q17R60 797 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 PROX2Q3B8N5 592 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 WASHC2DQ5SRD0 308 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 IL23RQ5VWK5 629 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 GALNT18Q6P9A2 607 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 IYDQ6PHW0 289 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 IGF2-ASQ6U949 168 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 C16orf89Q6UX73 402 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 C17orf64Q86WR6 236 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 POU5F2Q8N7G0 328 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 LINC01555Q8NAE3 123 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 FBXO27Q8NI29 283 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 PROKR1Q8TCW9 393 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 ROPN1LQ96C74 230 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 SLC46A1Q96NT5 459 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 PHF12Q96QT6 1004 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 SARGQ9BW04 601 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 GSDMCQ9BYG8 508 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 TMEM168Q9H0V1 697 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 CCDC167Q9P0B6 97 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 VPS29Q9UBQ0 182 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 GIMAP2Q9UG22 337 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 ICE1Q9Y2F5 2266 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 POLQO75417 2590 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 ANKRD12Q6UB98 2062 aa11.45□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 NBASA2RRP1 2371 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 A0A088AWK7 358 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms