RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 HPP00738 406 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 S100BP04271 92 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 GDF5P43026 501 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 GLRBP48167 497 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 GPX6P59796 221 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 GUCY2DQ02846 1103 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 RGS1Q08116 209 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 CBLBQ13191 982 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 SLMAPQ14BN4 828 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 SLC6A19Q695T7 634 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 SBSNQ6UWP8 590 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ZDHHC24Q6UX98 284 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 CYS1Q717R9 158 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 PRSS41Q7RTY9 318 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 VN1R4Q7Z5H5 301 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 GPSM1Q86YR5 675 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 C10orf67Q8IYJ2 551 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF454Q8N9F8 522 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ABHD11Q8NFV4 315 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 FBF1Q8TES7 1133 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 NEIL2Q969S2 332 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 AGAP4Q96P64 663 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 OR4K3Q96R72 315 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 AIF1LQ9BQI0 150 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 LHPPQ9H008 270 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 EPS8L2Q9H6S3 715 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 POPDC3Q9HBV1 291 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 WWOXQ9NZC7 414 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 HCN3Q9P1Z3 774 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 DOCK10Q96BY6 2186 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 SHANK1Q9Y566 2161 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 TRBC2A0A5B9 178 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 CTAGE15A4D2H0 777 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 URADA6NGE7 173 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 JRKO75564 520 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 FAM155BO75949 473 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 WFS1O76024 890 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 KLHL18O94889 574 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 BMP10O95393 424 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 CTAGE8P0CG41 777 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 C8orf89P0DMQ9 161 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 GNAZP19086 355 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 PHBP35232 272 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 HNF4AP41235 474 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 XCR1P46094 333 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 SOX8P57073 446 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 RAB10P61026 200 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ATP6V0D1P61421 351 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 SKP1P63208 163 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 CDKL1Q00532 357 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 PWP1Q13610 501 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 CASP8Q14790 479 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 HERC3Q15034 1050 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 TGFBIQ15582 683 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 PPP1R3AQ16821 1122 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 HSP90B2PQ58FF3 399 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ATG9BQ674R7 924 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 NXPE4Q6UWF7 544 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00696Q6ZRV3 163 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 CEP128Q6ZU80 1094 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFAF7Q7L592 441 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 CTAGE6Q86UF2 777 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 CTAGE4Q8IX94 777 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 KBTBD2Q8IY47 623 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 IQCKQ8N0W5 287 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 TCAIMQ8N3R3 496 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 AMER3Q8N944 861 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 SNX31Q8N9S9 440 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF740Q8NDX6 193 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 TRPV3Q8NET8 790 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 OR4K1Q8NGD4 311 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 DNAJB14Q8TBM8 379 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 IFT81Q8WYA0 676 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 CCT6BQ92526 530 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 EXT2Q93063 718 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 PNPLA2Q96AD5 504 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 MIB2Q96AX9 1013 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 TM4SF19Q96DZ7 209 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 PEX11GQ96HA9 241 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 CNDP1Q96KN2 507 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 GPR22Q99680 433 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 MESP1Q9BRJ9 268 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 CAPS2Q9BXY5 557 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 PHACTR1Q9C0D0 580 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 TGIF2Q9GZN2 237 aa7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms