RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578501.5

CSNK1D-208, Transcript of casein kinase 1 delta, human

TSL 2

Gene CSNK1D, Length 1,124 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1D-208	ENST00000578501	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	TRPV3	Q8NET8	790 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	NXNL1	Q96CM4	212 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	NT5DC2	Q9H857	520 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	GPR83	Q9NYM4	423 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	WWOX	Q9NZC7	414 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	CD274	Q9NZQ7	290 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	C3orf18	Q9UK00	162 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501		A0A096LPK6	155 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	SYCE1L	A8MT33	242 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	IDS	B3KWA1	339 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	NDUFS4	O43181	175 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	KLHL2	O95198	593 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	BMP10	O95393	424 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	STATH	P02808	62 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	PDGFA	P04085	211 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	IL10	P22301	178 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	TYK2	P29597	1187 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	GMPR	P36959	345 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	MAGEA12	P43365	314 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	HSPA7	P48741	367 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	CD97	P48960	835 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	EMP2	P54851	167 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	SKP1	P63208	163 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	KLRB1	Q12918	225 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	BMPR2	Q13873	1038 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	MYBPC3	Q14896	1274 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	ACAP2	Q15057	778 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	RBBP7	Q16576	425 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	GALNT16	Q8N428	558 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	TTL	Q8NG68	377 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	WDR34	Q96EX3	536 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	PAFAH2	Q99487	392 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	CD244	Q9BZW8	370 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	C5AR2	Q9P296	337 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	PLAA	Q9Y263	795 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	CREBBP	Q92793	2442 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	URAD	A6NGE7	173 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501		A6NL46	340 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	CLGN	O14967	610 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRT38	O76015	456 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	KLHL18	O94889	574 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	HP	P00738	406 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	SERPINA6	P08185	405 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	MTHFD2	P13995	350 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	ALOX12	P18054	663 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	IL1RN	P18510	177 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	NR1D1	P20393	614 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	CASP2	P42575	452 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	MSH2	P43246	934 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	PCDH1	Q08174	1060 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	E2F2	Q14209	437 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	TBCC	Q15814	346 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	PDK4	Q16654	411 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	KLC3	Q6P597	504 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	ABHD13	Q7L211	337 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	PDSS2	Q86YH6	399 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	CNPY4	Q8N129	248 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRT78	Q8N1N4	520 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	TEX19	Q8NA77	164 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		12.91	□□□□□ -0.34

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