RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563065.5

CCNDBP1-204, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,450 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-204ENST00000563065 TMEM237Q96Q45 408 aa16.59■□□□□ 0.25
CCNDBP1-204ENST00000563065 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
CCNDBP1-204ENST00000563065 EFCAB11Q9BUY7 163 aa16.59■□□□□ 0.25
CCNDBP1-204ENST00000563065 DRC3Q9H069 523 aa16.59■□□□□ 0.25
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF304Q9HCX3 659 aa16.59■□□□□ 0.25
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC17A7Q9P2U7 560 aa16.59■□□□□ 0.25
CCNDBP1-204ENST00000563065 C21orf140B9A014 251 aa16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 C4orf51C9J302 202 aa16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 DNAJB6O75190 326 aa16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 FURINP09958 794 aa16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC35G6P0C7Q6 338 aa16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRKAR1AP10644 381 aa16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRKAA2P54646 552 aa16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 RPS15P62841 145 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 HERVK_113P63132 956 aa16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 PCDH1Q08174 1060 aa16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 VAC14Q08AM6 782 aa16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 PWP1Q13610 501 aa16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 ERV3-1Q14264 604 aa16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 NCF4Q15080 339 aa16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCDC153Q494R4 210 aa16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 LRIG3Q6UXM1 1119 aa16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZYG11AQ6WRX3 759 aa16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 PDSS2Q86YH6 399 aa16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCDC63Q8NA47 563 aa16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 ARMC2Q8NEN0 867 aa16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 NT5CQ8TCD5 201 aa16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 ATP6V1E2Q96A05 226 aa16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 APOPT1Q96IL0 206 aa16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 ERVK-6Q9BXR3 956 aa16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRORYQ9H606 182 aa16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 NT5DC2Q9H857 520 aa16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 ACTR8Q9H981 624 aa16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 COPG2Q9UBF2 871 aa16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 CTSFQ9UBX1 484 aa16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 KCND3Q9UK17 655 aa16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 PLLPQ9Y342 182 aa16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 ITPR1Q14643 2758 aa16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 C9J4A7 227 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 SGK494L7N484 410 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 SH3BGRLO75368 114 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 SUPT7LO94864 414 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 RAB40ALP0C0E4 278 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 MYL2P10916 166 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 PCNAP12004 261 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 IMPDH1P20839 514 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 PIK3CGP48736 1102 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCNG1P51959 295 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 UCNP55089 124 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 RAB8AP61006 207 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 FAM53BQ14153 422 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 NDUFA9Q16795 377 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 GRHL2Q6ISB3 625 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 OVCH1Q7RTY7 1134 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 EXOC3L1Q86VI1 746 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 AMER3Q8N944 861 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRPV3Q8NET8 790 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 TCP10LQ8TDR4 215 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRPC4APQ8TEL6 797 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 SMC6Q96SB8 1091 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 GPR87Q9BY21 358 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC6A16Q9GZN6 736 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 TCFL5Q9UL49 500 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF860A6NHJ4 632 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 ANKDD1BA6NHY2 528 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 CREG1O75629 220 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 ONECUT2O95948 504 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 SERPINA6P08185 405 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 CPA3P15088 417 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 RGS1Q08116 209 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRAF3Q13114 568 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 LAPTM5Q13571 262 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 IL10RAQ13651 578 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 CASP8Q14790 479 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 RBBP7Q16576 425 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 PAGE2BQ5JRK9 111 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 LIPJQ5W064 366 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 MED27Q6P2C8 311 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRMT9Q6P2P2 845 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRSS58Q8IYP2 241 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR7G3Q8NG95 312 aa16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms