RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560983.1

HERC1-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, humanhuman

TSL 2

Gene HERC1, Length 457 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1-211ENST00000560983 NPIPA1Q9UND3 350 aa3.56□□□□□ -1.84
HERC1-211ENST00000560983 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa3.56□□□□□ -1.84
HERC1-211ENST00000560983 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa3.56□□□□□ -1.84
HERC1-211ENST00000560983 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa3.55□□□□□ -1.84
HERC1-211ENST00000560983 DYTNA2CJ06 578 aa3.55□□□□□ -1.84
HERC1-211ENST00000560983 ASPDHA6ND91 283 aa3.55□□□□□ -1.84
HERC1-211ENST00000560983 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
HERC1-211ENST00000560983 LRRC14BA6NHZ5 514 aa3.55□□□□□ -1.84
HERC1-211ENST00000560983 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
HERC1-211ENST00000560983 OR52A4PA6NMU1 304 aa3.55□□□□□ -1.84
HERC1-211ENST00000560983 IDSB3KWA1 339 aa3.55□□□□□ -1.84
HERC1-211ENST00000560983 FAM227AF5H4B4 570 aa3.55□□□□□ -1.84
HERC1-211ENST00000560983 PPP6CO00743 305 aa3.55□□□□□ -1.84
HERC1-211ENST00000560983 TJP3O95049 919 aa3.55□□□□□ -1.84
HERC1-211ENST00000560983 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
HERC1-211ENST00000560983 TSPAN12O95859 305 aa3.55□□□□□ -1.84
HERC1-211ENST00000560983 NR3C1P04150 777 aa3.55□□□□□ -1.84
HERC1-211ENST00000560983 TUBB4AP04350 444 aa3.55□□□□□ -1.84
HERC1-211ENST00000560983 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
HERC1-211ENST00000560983 CD63P08962 238 aa3.55□□□□□ -1.84
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HERC1-211ENST00000560983 IDSP22304 550 aa3.55□□□□□ -1.84
HERC1-211ENST00000560983 GTF2H1P32780 548 aa3.55□□□□□ -1.84
HERC1-211ENST00000560983 ACADSBP45954 432 aa3.55□□□□□ -1.84
HERC1-211ENST00000560983 GPR1P46091 355 aa3.55□□□□□ -1.84
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HERC1-211ENST00000560983 ARSEP51690 589 aa3.55□□□□□ -1.84
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HERC1-211ENST00000560983 STK4Q13043 487 aa3.55□□□□□ -1.84
HERC1-211ENST00000560983 GRM3Q14832 879 aa3.55□□□□□ -1.84
HERC1-211ENST00000560983 BRMS1LQ5PSV4 323 aa3.55□□□□□ -1.84
HERC1-211ENST00000560983 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
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HERC1-211ENST00000560983 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa3.55□□□□□ -1.84
HERC1-211ENST00000560983 DENND2CQ68D51 928 aa3.55□□□□□ -1.84
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HERC1-211ENST00000560983 FAM184AQ8NB25 1140 aa3.55□□□□□ -1.84
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HERC1-211ENST00000560983 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa3.55□□□□□ -1.84
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HERC1-211ENST00000560983 GOLGA6DP0CG33 693 aa3.54□□□□□ -1.84
HERC1-211ENST00000560983 ABOP16442 354 aa3.54□□□□□ -1.84
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HERC1-211ENST00000560983 LIPAP38571 399 aa3.54□□□□□ -1.84
HERC1-211ENST00000560983 STAT6P42226 847 aa3.54□□□□□ -1.84
HERC1-211ENST00000560983 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
HERC1-211ENST00000560983 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
HERC1-211ENST00000560983 ZNF134P52741 427 aa3.54□□□□□ -1.84
HERC1-211ENST00000560983 NUP107P57740 925 aa3.54□□□□□ -1.84
HERC1-211ENST00000560983 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
HERC1-211ENST00000560983 DMTNQ08495 405 aa3.54□□□□□ -1.84
HERC1-211ENST00000560983 ETFDHQ16134 617 aa3.54□□□□□ -1.84
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