RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	GMPR	P36959	345 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	SLCO1A2	P46721	670 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	GABRA4	P48169	554 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	RAB28	P51157	221 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	ATP6V0D1	P61421	351 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	PHKG1	Q16816	387 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	SBSN	Q6UWP8	590 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	MZB1	Q8WU39	189 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	C14orf79	Q96F83	325 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	IP6K3	Q96PC2	410 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	PKP4	Q99569	1192 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	ACAN	P16112	2415 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	MATN2	O00339	956 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	CD1E	P15812	388 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	CD1D	P15813	335 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	IST1	P53990	364 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	IRF9	Q00978	393 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	DLG1	Q12959	904 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	CSHL1	Q14406	222 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	C8orf44	Q96CB5	159 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	IL17F	Q96PD4	163 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	TBK1	Q9UHD2	729 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	SMIM23	A6NLE4	172 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	SLC16A8	O95907	504 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	ALAS2	P22557	587 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	HSD17B2	P37059	387 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	AP1S2	P56377	157 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	ARG2	P78540	354 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	PRKAA1	Q13131	559 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	MFAP5	Q13361	173 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	XKRX	Q6PP77	449 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	RPTN	Q6XPR3	784 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	COX15	Q7KZN9	410 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	ZNF480	Q8WV37	535 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	KIAA1191	Q96A73	305 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	NXNL1	Q96CM4	212 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	CCDC138	Q96M89	665 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	GPR78	Q96P69	363 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	LHPP	Q9H008	270 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	VPS11	Q9H270	941 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	LIME1	Q9H400	295 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	CTSF	Q9UBX1	484 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	OARD1	Q9Y530	152 aa		13.11	□□□□□ -0.31

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