RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551092.5

ARL1-208, Transcript of ADP ribosylation factor like GTPase 1, human

TSL 5

Gene ARL1, Length 731 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARL1-208	ENST00000551092	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	ZNHIT1	O43257	154 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	B3GALT4	O96024	378 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	C8G	P07360	202 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	COX6B1	P14854	86 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	CD46	P15529	392 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	GRK3	P35626	688 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	MAGEA3	P43357	314 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	PHKG1	Q16816	387 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	LCTL	Q6UWM7	567 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	PYCR2	Q96C36	320 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	SCMH1	Q96GD3	660 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	MAGED4	Q96JG8	741 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	LPAR4	Q99677	370 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	SGPP1	Q9BX95	441 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	LANCL2	Q9NS86	450 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	GTF3C1	Q12789	2109 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	OR1F1	O43749	312 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	SERPIND1	P05546	499 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	SP1	P08047	785 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	HIST1H2AD	P20671	130 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	IL10	P22301	178 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	GABRB3	P28472	473 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	PTGER4	P35408	488 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	RGS4	P49798	205 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	CDKN2D	P55273	166 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	OR4D2	P58180	307 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	SLC26A5	P58743	744 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	OLR1	P78380	273 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	CDSN	Q15517	529 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	SLC5A8	Q8N695	610 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	OR1F2P	Q96R84	312 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	LRFN1	Q9P244	771 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	ASPDH	A6ND91	283 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	C19orf84	I3L1E1	186 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	NDC80	O14777	642 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	SLC16A5	O15375	505 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	NDUFS4	O43181	175 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	CHST10	O43529	356 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	ASNA1	O43681	348 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	B4GALT2	O60909	372 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	NEURL1	O76050	574 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	MLYCD	O95822	493 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	FH	P07954	510 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	CCND1	P24385	295 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	CCR8	P51685	355 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	SMS	P52788	366 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	PGGT1B	P53609	377 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	TAS2R50	P59544	299 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	SP140	Q13342	867 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	HERC3	Q15034	1050 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	DEFB134	Q4QY38	66 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	CYP4X1	Q8N118	509 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARL1-208	ENST00000551092	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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