RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa9.16□□□□□ -0.94
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PTPRB-204ENST00000538708 TCTE1Q5JU00 501 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 SVOPLQ8N434 492 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 SFRP1Q8N474 314 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 NAT8LQ8N9F0 302 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 NAT14Q8WUY8 206 aa9.15□□□□□ -0.94
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