RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 HEMGNQ9BXL5 484 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 RAB20Q9NX57 234 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 COQ3Q9NZJ6 369 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 LRWD1Q9UFC0 647 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 SLC22A14Q9Y267 594 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 CKAP5Q14008 2032 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 MYMKA6NI61 221 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 CYSRT1A8MQ03 144 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 B5MCH6 92 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 GPR171O14626 319 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 RRP8O43159 456 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 IRAK2O43187 625 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 PROM1O43490 865 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 ITGA10O75578 1167 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 KAT7O95251 611 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 ESRRBO95718 433 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 APODP05090 189 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 PLA2G2AP14555 144 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 GABRG2P18507 467 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 FBLP22087 321 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 CHMP24386 653 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 CYP2F1P24903 491 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 CDC25AP30304 524 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 SLC7A1P30825 629 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 HOXD13P35453 343 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 GSTM5P46439 218 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 CLK3P49761 638 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 TAF6P49848 677 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 BCAP31P51572 246 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 STX1BP61266 288 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 NHLH2Q02577 135 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 CHAF1BQ13112 559 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 CHIT1Q13231 466 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 PTPRRQ15256 657 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 BEAN1Q3B7T3 259 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 GTDC1Q4AE62 458 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 YIF1BQ5BJH7 314 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 C6orf10Q5SRN2 563 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 CES4AQ5XG92 561 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 LRRC8BQ6P9F7 803 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 SLC36A4Q6YBV0 504 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 ARHGEF19Q8IW93 802 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 C4orf32Q8N8J7 132 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 OR5T1Q8NG75 326 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 ZNF671Q8TAW3 534 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 SNX33Q8WV41 574 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 PHF21AQ96BD5 680 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 PNKPQ96T60 521 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 TEX101Q9BY14 249 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 TWSG1Q9GZX9 223 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 CAB39LQ9H9S4 337 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 MID1IP1Q9NPA3 183 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 IL26Q9NPH9 171 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 RAB21Q9UL25 225 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 FAM172BPA6NC97 362 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 PP2D1A8MPX8 630 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 A8MXE2 369 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 FOXO6A8MYZ6 492 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 H0Y8G0 127 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 TO15178 435 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 SCO2O43819 266 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 JAK2O60674 1132 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 CYTIPO60759 359 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 NSA2O95478 260 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 PNPP00491 289 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 PIGRP01833 764 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 DHRS4L1P0CG22 281 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 LIG4P49917 911 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 TAS2R40P59535 323 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 LIPEQ05469 1076 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 GRIK2Q13002 908 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 RESTQ13127 1097 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 ADIPOQQ15848 244 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 ZNF805Q5CZA5 627 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 ATAD3BQ5T9A4 648 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 SLX4IPQ5VYV7 408 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 SLC39A4Q6P5W5 647 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 HDDC2Q7Z4H3 204 aa7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms