RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533051.5

SLC43A3-222, Transcript of solute carrier family 43 member 3, human

TSL 2

Gene SLC43A3, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC43A3-222	ENST00000533051	TUBB	P07437	444 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-222	ENST00000533051	RBP1	P09455	135 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-222	ENST00000533051	NPPB	P16860	134 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-222	ENST00000533051	GNAZ	P19086	355 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-222	ENST00000533051	CXCR2	P25025	360 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-222	ENST00000533051	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-222	ENST00000533051	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-222	ENST00000533051	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-222	ENST00000533051	GPS2	Q13227	327 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-222	ENST00000533051	ACAP2	Q15057	778 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-222	ENST00000533051	UGT8	Q16880	541 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-222	ENST00000533051	MUM1	Q2TAK8	710 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-222	ENST00000533051	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-222	ENST00000533051	MLIP	Q5VWP3	458 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-222	ENST00000533051	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-222	ENST00000533051	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-222	ENST00000533051	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-222	ENST00000533051	PAQR7	Q86WK9	346 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-222	ENST00000533051	HPS6	Q86YV9	775 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-222	ENST00000533051	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-222	ENST00000533051	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-222	ENST00000533051	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-222	ENST00000533051	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-222	ENST00000533051	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-222	ENST00000533051	THAP11	Q96EK4	314 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-222	ENST00000533051	RUFY1	Q96T51	708 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-222	ENST00000533051	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-222	ENST00000533051	CHST8	Q9H2A9	424 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-222	ENST00000533051	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-222	ENST00000533051	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-222	ENST00000533051	FETUB	Q9UGM5	382 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-222	ENST00000533051	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-222	ENST00000533051	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-222	ENST00000533051	SMIM23	A6NLE4	172 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	HCRTR1	O43613	425 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	OR1F1	O43749	312 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	CEACAM4	O75871	244 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	SERPIND1	P05546	499 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	MYBL2	P10244	700 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	COL6A2	P12110	1019 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	CD1E	P15812	388 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	GABRA4	P48169	554 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	VSNL1	P62760	191 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	IRF9	Q00978	393 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	RELA	Q04206	551 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	IL10RA	Q13651	578 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	OR4D1	Q15615	310 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	ZNF425	Q6IV72	752 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	EMB	Q6PCB8	327 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	PTER	Q96BW5	349 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	TBK1	Q9UHD2	729 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	FEZF1	A0PJY2	475 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051		A6NL46	340 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	DSCR3	O14972	297 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	SMIM24	O75264	130 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	KRT15	P19012	456 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	PTPN4	P29074	926 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	GDF5	P43026	501 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	HSPA7	P48741	367 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	CSNK1G2	P78368	415 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	CDC16	Q13042	620 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	ART3	Q13508	389 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	WDR93	Q6P2C0	686 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	ISCA2	Q86U28	154 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	FJX1	Q86VR8	437 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	PLD3	Q8IV08	490 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	KRT78	Q8N1N4	520 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	NEIL2	Q969S2	332 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-222	ENST00000533051	PELI2	Q9HAT8	420 aa		13.57	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms