RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 C7orf26Q96N11 449 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-208ENST00000529677 PRAP1Q96NZ9 151 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-208ENST00000529677 AIF1LQ9BQI0 150 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-208ENST00000529677 SPNS1Q9H2V7 528 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-208ENST00000529677 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-208ENST00000529677 MID1IP1Q9NPA3 183 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-208ENST00000529677 ENAMQ9NRM1 1142 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-208ENST00000529677 KLHL20Q9Y2M5 609 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-208ENST00000529677 RNF11Q9Y3C5 154 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-208ENST00000529677 RAP2CQ9Y3L5 183 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-208ENST00000529677 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa16.08■□□□□ 0.17
PACS1-208ENST00000529677 TRBC2A0A5B9 178 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 H0YIV9 168 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 OR4F21O95013 312 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 NELFEP18615 380 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 GSTM2P28161 218 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 GUCY1A3Q02108 690 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 PAGE2BQ5JRK9 111 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 RNF165Q6ZSG1 346 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 KIRREL3Q8IZU9 778 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 D2HGDHQ8N465 521 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 DNAJC22Q8N4W6 341 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 ATP6V1E2Q96A05 226 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 THAP11Q96EK4 314 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 SEC16BQ96JE7 1060 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 CCDC74BQ96LY2 380 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 TMEM74Q96NL1 305 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 CDK15Q96Q40 435 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 ZMYND15Q9H091 742 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 WDR70Q9NW82 654 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 HAT1O14929 419 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 HGSO14964 777 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 NRP2O60462 931 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 CTSVO60911 334 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 RASSF9O75901 435 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 HSPA4LO95757 839 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 CASRP41180 1078 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 SCTRP47872 440 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 INHBCP55103 352 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 HSD11B2P80365 405 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 KANK2Q63ZY3 851 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 KRT78Q8N1N4 520 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 ZNF740Q8NDX6 193 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 UBE2E3Q969T4 207 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 ZNF285Q96NJ3 590 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 RHBGQ9H310 441 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 FAM60AQ9NP50 221 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 KLHL3Q9UH77 587 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 SRPK3Q9UPE1 567 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 SERTM1A2A2V5 107 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 PLD2O14939 933 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 AZIN1O14977 448 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 UROSP10746 265 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 LIPCP11150 499 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 MPSTP25325 297 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 SERPINB1P30740 379 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 GRK3P35626 688 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 AHRP35869 848 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 BCL6P41182 706 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 ZNF33BQ06732 778 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 MED27Q6P2C8 311 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 FBXO42Q6P3S6 717 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 MFSD9Q8NBP5 474 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 OR7G3Q8NG95 312 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 WDR20Q8TBZ3 569 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 OR2A5Q96R48 311 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 KLHL25Q9H0H3 589 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 SYNPO2LQ9H987 977 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 PDE7BQ9NP56 450 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 PPT2Q9UMR5 302 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 C2CD3Q4AC94 2353 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 PRAMEF10O60809 474 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 CAPN1P07384 714 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 RNF224P0DH78 156 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 FOXA1P55317 472 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 UGT3A2Q3SY77 523 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 FRG2Q64ET8 278 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms