RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523636.5

PABPC1-223, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 5

Gene PABPC1, Length 818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-223	ENST00000523636	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	C3orf20	Q8ND61	904 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	THRSP	Q92748	146 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	C18orf12	Q96KH6	178 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	IFT74	Q96LB3	600 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	KCNK16	Q96T55	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	RAB34	Q9BZG1	259 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	STRADB	Q9C0K7	418 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	LIME1	Q9H400	295 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	POLD4	Q9HCU8	107 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CENPM	Q9NSP4	180 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PNPO	Q9NVS9	261 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SPAST	Q9UBP0	616 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	GMEB1	Q9Y692	573 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	NFS1	Q9Y697	457 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	HCFC1	P51610	2035 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CYB561D2	O14569	222 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PCDH17	O14917	1159 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	DNPH1	O43598	174 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MATN4	O95460	622 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	KRT14	P02533	472 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SPARC	P09486	303 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CYP11B2	P19099	503 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TCN2	P20062	427 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CYP3A5	P20815	502 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	NR2F2	P24468	414 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	STAT6	P42226	847 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CLCNKA	P51800	687 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	RPS6KA3	P51812	740 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	BMX	P51813	675 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	NME5	P56597	212 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC8A3	P57103	927 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CSNK2B	P67870	215 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CDK18	Q07002	472 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	FOXM1	Q08050	763 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636		Q0VFX4	171 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TAF10	Q12962	218 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	FZD2	Q14332	565 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	RPS6KA2	Q15349	733 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	RPS6KA1	Q15418	735 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	NFIL3	Q16649	462 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	INSC	Q1MX18	579 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	BTBD16	Q32M84	506 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	NAA35	Q5VZE5	725 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	COMTD1	Q86VU5	262 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	POC5	Q8NA72	575 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	KDM1B	Q8NB78	822 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	C3orf49	Q96BT1	292 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PIP5K1A	Q99755	562 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MYOC	Q99972	504 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62

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