RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516232.1

RNA5SP228-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 228, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP228, Length 133 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP228-201ENST00000516232 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RNA5SP228-201ENST00000516232 TEX264Q9Y6I9 313 aa4.91□□□□□ -1.62
RNA5SP228-201ENST00000516232 STYXL1Q9Y6J8 313 aa4.91□□□□□ -1.62
RNA5SP228-201ENST00000516232 RYR3Q15413 4870 aa4.91□□□□□ -1.62
RNA5SP228-201ENST00000516232 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa4.9□□□□□ -1.62
RNA5SP228-201ENST00000516232 SVEP1Q4LDE5 3571 aa4.9□□□□□ -1.62
RNA5SP228-201ENST00000516232 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 EFCAB8A8MWE9 144 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 TARM1B6A8C7 271 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 PEX12O00623 359 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 PCDH17O14917 1159 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 CLIC2O15247 247 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 MED7O43513 233 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 JRKO75564 520 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 CTAG2O75638 210 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 RASAL1O95294 804 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 OR2C1O95371 312 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 LATS1O95835 1130 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 OPN1LWP04000 364 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 PCCBP05166 539 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 CLUP10909 449 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 ADRB3P13945 408 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 CALB2P22676 271 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 DNASE1P24855 282 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 IL1R2P27930 398 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 SERPINA4P29622 427 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 SOAT1P35610 550 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 CAPGP40121 348 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 HTR2BP41595 481 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 MAGEA1P43355 309 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 ARHGDIBP52566 201 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 SMSP52788 366 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 DGKQP52824 942 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 NAGLUP54802 743 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 ARPC4P59998 168 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 SRP54P61011 504 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 ACTR3P61158 418 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 UBE2HP62256 183 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 RELBQ01201 579 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 POU4F1Q01851 419 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 ASPHQ12797 758 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 RAB32Q13637 225 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 KRT31Q15323 416 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 DLG2Q15700 870 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 BTBD16Q32M84 506 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 HMBOX1Q6NT76 420 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 TMEM71Q6P5X7 295 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 ENPP7Q6UWV6 458 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 TRIM72Q6ZMU5 477 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 SYVN1Q86TM6 617 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 AMZ2Q86W34 360 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 SYCE1Q8N0S2 351 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 FAM185AQ8N0U4 392 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 CFAP52Q8N1V2 620 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 BBS1Q8NFJ9 593 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 ACTRT2Q8TDY3 377 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 FAR1Q8WVX9 515 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 GLMPQ8WWB7 406 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 TMEM186Q96B77 213 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 TMCO6Q96DC7 493 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 ELMO2Q96JJ3 720 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 SSX3Q99909 188 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 ZNF559Q9BR84 538 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 C1orf43Q9BWL3 253 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 RMND5AQ9H871 391 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 SPACA1Q9HBV2 294 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 LZTFL1Q9NQ48 299 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 KLC4Q9NSK0 619 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 OLAHQ9NV23 265 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 NUDT15Q9NV35 164 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 KCND2Q9NZV8 630 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 SLC25A13Q9UJS0 675 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 CSAG2Q9Y5P2 127 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 GSAPA4D1B5 854 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 SH3D21A4FU49 640 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 HTR3EA5X5Y0 456 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms