RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 KCND3Q9UK17 655 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 POMT2Q9UKY4 750 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 SPEF1Q9Y4P9 236 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 PCDH15Q96QU1 1955 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 E7ENX8 843 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 MASP2O00187 686 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 TGFB1P01137 390 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 MYZAPP0CAP1 466 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 CBSLP0DN79 551 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 LIPCP11150 499 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 PNLIPP16233 465 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 ITGAXP20702 1163 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 HPDP32754 393 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 CBSP35520 551 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 CCT5P48643 541 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 TAP2Q03519 686 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 ACVR1Q04771 509 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 RGS1Q08116 209 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 DNASE1L3Q13609 305 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 SYT16Q17RD7 645 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 HKDC1Q2TB90 917 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 VWA2Q5GFL6 755 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 ASB11Q8WXH4 323 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 MOCOSQ96EN8 888 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 SGCZQ96LD1 299 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 AIF1LQ9BQI0 150 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 XPR1Q9UBH6 696 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 ZZEF1O43149 2961 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 HYKKA2RU49 373 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 SGK494L7N484 410 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 JRKO75564 520 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 CCNDBP1O95273 360 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 GNAZP19086 355 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 NME2P22392 152 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 ACADLP28330 430 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 CRABP2P29373 138 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 HMOX2P30519 316 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 ALDH9A1P49189 494 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 CCR8P51685 355 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 TMPRSS3P57727 454 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 DMPKQ09013 629 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 NDUFA9Q16795 377 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 FRMPD2BQ6IN97 320 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 IGF2-ASQ6U949 168 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 KCT2Q8NC54 265 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 OR9A4Q8NGU2 314 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 C8orf44Q96CB5 159 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 PEX11GQ96HA9 241 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 OR2A14Q96R47 310 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 CD180Q99467 661 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 CUTCQ9NTM9 273 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 POLHQ9Y253 713 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 LRRC14BA6NHZ5 514 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 TTLL8A6PVC2 850 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 AGAP14A8MT82 685 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 RNF223E7ERA6 249 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 TK2O00142 265 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 NVLO15381 856 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 ERI3O43414 337 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 HCRTR1O43613 425 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 DNAJB5O75953 348 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 GBAP04062 536 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 GSTM1P09488 218 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 FOLR3P41439 243 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 MAGEA6P43360 314 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 CCNG1P51959 295 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 ID2Q02363 134 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 GSTM4Q03013 218 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 TGFBIQ15582 683 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 IMPG1Q17R60 797 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 OR8H2Q8N162 312 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 PPP1R35Q8TAP8 253 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 DLG3Q92796 817 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 MYLK2Q9H1R3 596 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 ACTL8Q9H568 366 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 ELOVL6Q9H5J4 265 aa6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms