RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 CLDN9O95484 217 aa25.52■■□□□ 1.68
SH3BP2-212ENST00000508338 MLYCDO95822 493 aa25.52■■□□□ 1.68
SH3BP2-212ENST00000508338 CPA3P15088 417 aa25.52■■□□□ 1.68
SH3BP2-212ENST00000508338 PTPN4P29074 926 aa25.52■■□□□ 1.68
SH3BP2-212ENST00000508338 DNAJB13P59910 316 aa25.52■■□□□ 1.68
SH3BP2-212ENST00000508338 PHEXP78562 749 aa25.52■■□□□ 1.68
SH3BP2-212ENST00000508338 NCF4Q15080 339 aa25.52■■□□□ 1.68
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF678Q5SXM1 525 aa25.52■■□□□ 1.68
SH3BP2-212ENST00000508338 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP25.52■■□□□ 1.68
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SH3BP2-212ENST00000508338 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
SH3BP2-212ENST00000508338 ANKHQ9HCJ1 492 aa25.52■■□□□ 1.68
SH3BP2-212ENST00000508338 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
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SH3BP2-212ENST00000508338 H0YIV9 168 aa25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 H3BQF6 201 aa25.51■■□□□ 1.67
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SH3BP2-212ENST00000508338 SUPT7LO94864 414 aa25.51■■□□□ 1.67
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SH3BP2-212ENST00000508338 ITPKBP27987 946 aa25.51■■□□□ 1.67
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SH3BP2-212ENST00000508338 DSG2Q14126 1118 aa25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM198BQ6UWH4 519 aa25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 OVCH1Q7RTY7 1134 aa25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 CREB3L4Q8TEY5 395 aa25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 COL26A1Q96A83 441 aa25.51■■□□□ 1.67
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SH3BP2-212ENST00000508338 SLC26A1Q9H2B4 701 aa25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 WDR54Q9H977 334 aa25.51■■□□□ 1.67
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SH3BP2-212ENST00000508338 A0A088AWK7 358 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 K7ENP7 123 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 EFSO43281 561 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 CD22P20273 847 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 CLCQ05315 142 aa25.5■■□□□ 1.67
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SH3BP2-212ENST00000508338 ARHGAP40Q5TG30 622 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
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SH3BP2-212ENST00000508338 SYVN1Q86TM6 617 aa25.5■■□□□ 1.67
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SH3BP2-212ENST00000508338 HOMEZQ8IX15 550 aa25.5■■□□□ 1.67
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SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM237Q96Q45 408 aa25.5■■□□□ 1.67
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SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
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SH3BP2-212ENST00000508338 LIPMQ5VYY2 423 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 MILR1Q7Z6M3 343 aa25.49■■□□□ 1.67
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SH3BP2-212ENST00000508338 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
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SH3BP2-212ENST00000508338 ALOX12P18054 663 aa25.48■■□□□ 1.67
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SH3BP2-212ENST00000508338 ACTL8Q9H568 366 aa25.48■■□□□ 1.67
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SH3BP2-212ENST00000508338 TCFL5Q9UL49 500 aa25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa25.48■■□□□ 1.67
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SH3BP2-212ENST00000508338 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 TM9SF1O15321 606 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 FOXS1O43638 330 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 SPAG7O75391 227 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 ITGAXP20702 1163 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 PKNOX1P55347 436 aa25.47■■□□□ 1.67
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