RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	MVB12A	Q96EY5	273 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	FOPNL	Q96NB1	174 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	MENT	Q9BUN1	341 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	HES7	Q9BYE0	225 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	IFNK	Q9P0W0	207 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ALG6	Q9Y672	507 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	SPG11	Q96JI7	2443 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1B0GTL3	188 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	IQCF5	A8MTL0	148 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNHIT1	O43257	154 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	PAX4	O43316	350 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	NRP2	O60462	931 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ZWINT	O95229	277 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ATE1	O95260	518 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	TPO	P07202	933 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXN2	P32314	431 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	AVPR1B	P47901	424 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	MARCKSL1	P49006	195 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	MYBPH	Q13203	477 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	IKZF1	Q13422	519 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	GRB7	Q14451	532 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	IQCB1	Q15051	598 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	MEP1A	Q16819	746 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	SYT16	Q17RD7	645 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC38	Q502W7	563 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	CES4A	Q5XG92	561 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	SPINK14	Q6IE38	97 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ADCK2	Q7Z695	626 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	DPH7	Q9BTV6	452 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	DRC3	Q9H069	523 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	GPC4	O75487	556 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	CD96	P40200	585 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC26A3	P40879	764 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	CCNF	P41002	786 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	CETN2	P41208	172 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	TAS2R50	P59544	299 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	PRAME	P78395	509 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFA9	Q16795	377 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	PARP6	Q2NL67	630 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	HKDC1	Q2TB90	917 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM205	Q6UW68	189 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	LUZP1	Q86V48	1076 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT222	Q8N1A0	295 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC5A8	Q8N695	610 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	AMER2	Q8N7J2	671 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	AMER3	Q8N944	861 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	MDS2	Q8NDY4	140 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ASB5	Q8WWX0	329 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	HDAC10	Q969S8	669 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	PANX3	Q96QZ0	392 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	CARD6	Q9BX69	1037 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2A25	A4D2G3	310 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT87P	A6NCN2	255 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	ASPDH	A6ND91	283 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	USP27X	A6NNY8	438 aa		10.2	□□□□□ -0.78

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