RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	OR1F2P	Q96R84	312 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	SARG	Q9BW04	601 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIM4	Q9C037	500 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	EPN3	Q9H201	632 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	EHD1	Q9H4M9	534 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	OPTC	Q9UBM4	332 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	TMCO1	Q9UM00	188 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	SPACA6	W5XKT8	324 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	SGK494	L7N484	410 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	SOCS6	O14544	535 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	P2RX6	O15547	441 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	KERA	O60938	352 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	PIAS1	O75925	651 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	KLHL18	O94889	574 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	BMP10	O95393	424 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	STATH	P02808	62 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	SERPINA6	P08185	405 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	TFEB	P19484	476 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	NR1D1	P20393	614 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	SERPINB1	P30740	379 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	PIK3CG	P48736	1102 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	TAS2R50	P59544	299 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	REEP5	Q00765	189 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	IRF8	Q02556	426 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	ACAP2	Q15057	778 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	IQCK	Q8N0W5	287 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	KCT2	Q8NC54	265 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	PDPR	Q8NCN5	879 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	NT5C	Q8TCD5	201 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	REPS1	Q96D71	796 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	NUDT9	Q9BW91	350 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	VPS11	Q9H270	941 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	ALG9	Q9H6U8	611 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A096LPK6	155 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	CLDN4	O14493	209 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	FOXS1	O43638	330 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	SMIM24	O75264	130 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	RBP1	P09455	135 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	EPB42	P16452	691 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	GGT5	P36269	586 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	HNF4A	P41235	474 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC6A12	P48065	614 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	HSPA7	P48741	367 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	PGGT1B	P53609	377 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	ARG2	P78540	354 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	TRADD	Q15628	312 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	NSDHL	Q15738	373 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	EXT1	Q16394	746 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	DEFB134	Q4QY38	66 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	AMER3	Q8N944	861 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-231	ENST00000496246	SCYL1	Q96KG9	808 aa		10.73	□□□□□ -0.69

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