RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496076.1

CLTC-208, Transcript of clathrin heavy chain, humanhuman

TSL 2

Gene CLTC, Length 678 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTC-208ENST00000496076 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 RUNDC3BQ96NL0 473 aa3.51□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa3.51□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 ITM2BQ9Y287 266 aa3.51□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 HEG1Q9ULI3 1381 aa3.51□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 A0A1W2PRB8 838 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 KRT87PA6NCN2 255 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 SDR42E2A6NKP2 422 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 E9PI62 339 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 FLRT2O43155 660 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 ATP6AP2O75787 350 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 REC8O95072 547 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 IGKV3-15P01624 115 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 EPCAMP16422 314 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 GAP43P17677 238 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 EPORP19235 508 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 UGT1A4P22310 534 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 SLC6A6P31641 620 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 PGFP49763 221 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 KHKP50053 298 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 THOP1P52888 689 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 PDX1P52945 283 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 ARF5P84085 180 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 IL1RL1Q01638 556 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 P2RY6Q15077 328 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 NECTIN1Q15223 517 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 RPS6KA1Q15418 735 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 SGCBQ16585 318 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 NOTUMQ6P988 496 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 BTNL8Q6UX41 500 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 AMIGO1Q86WK6 493 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 MMD2Q8IY49 270 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 LGI2Q8N0V4 545 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 PPFIBP2Q8ND30 876 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 OR4K1Q8NGD4 311 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 PSMA8Q8TAA3 256 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 ZPLD1Q8TCW7 415 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 PIGBQ92521 554 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 PYCR2Q96C36 320 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 AP2M1Q96CW1 435 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 SOSTQ9BQB4 213 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 CCDC3Q9BQI4 270 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 PI4K2AQ9BTU6 479 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 TNMDQ9H2S6 317 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 A4GALTQ9NPC4 353 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 OLFML3Q9NRN5 406 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 P4HTMQ9NXG6 502 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 RNF186Q9NXI6 227 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 RARRES3Q9UL19 164 aa3.5□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 C5orf51A6NDU8 294 aa3.49□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 CASTOR2A6NHX0 329 aa3.49□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 PRSS46E5RG02 174 aa3.49□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 B3GALNT1O75752 331 aa3.49□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 STAM2O75886 525 aa3.49□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 SERPING1P05155 500 aa3.49□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 C8orf89P0DMQ9 161 aa3.49□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 PCP11498 1178 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 VCLP18206 1134 aa3.49□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 FRKP42685 505 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 MAGEB1P43366 347 aa3.49□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 NPBWR1P48145 328 aa3.49□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 SLC12A3P55017 1021 aa3.49□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 CDH11P55287 796 aa3.49□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 WASHC5Q12768 1159 aa3.49□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 UGT3A2Q3SY77 523 aa3.49□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 AARDQ4LEZ3 155 aa3.49□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 PARP10Q53GL7 1025 aa3.49□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 SPDYCQ5MJ68 293 aa3.49□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP3.49□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 FAM46CQ5VWP2 391 aa3.49□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 FAM166AQ6J272 317 aa3.49□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa3.49□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 RABEPKQ7Z6M1 372 aa3.49□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa3.49□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 SLC39A11Q8N1S5 342 aa3.49□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 DNAJC22Q8N4W6 341 aa3.49□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa3.49□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 ZNF383Q8NA42 475 aa3.49□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 CENPTQ96BT3 561 aa3.49□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 FAM20AQ96MK3 541 aa3.49□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 SPATA13Q96N96 652 aa3.49□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 PANX3Q96QZ0 392 aa3.49□□□□□ -1.85
CLTC-208ENST00000496076 GAL3ST4Q96RP7 486 aa3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms