RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487270.5

RAD51B-210, Transcript of RAD51 paralog B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD51B, Length 2,596 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51B-210ENST00000487270 MC1RQ01726 317 aa6.39□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 SP140Q13342 867 aa6.39□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 VEZF1Q14119 521 aa6.39□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 IQCCQ4KMZ1 466 aa6.39□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 PRSS36Q5K4E3 855 aa6.39□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.39□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.39□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 FAM124AQ86V42 546 aa6.39□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 NPAS3Q8IXF0 933 aa6.39□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 SYTL1Q8IYJ3 562 aa6.39□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 SLC5A8Q8N695 610 aa6.39□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa6.39□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 OR2A12Q8NGT7 310 aa6.39□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 OR5AK3PQ8NH89 298 aa6.39□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 MCFD2Q8NI22 146 aa6.39□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 DOHHQ9BU89 302 aa6.39□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa6.39□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.39□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 MROQ9BYG7 248 aa6.39□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 LINC00597Q9H2U6 94 aa6.39□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa6.39□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 RLIMQ9NVW2 624 aa6.39□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa6.39□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 SPG21Q9NZD8 308 aa6.39□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 NDUFAF4Q9P032 175 aa6.39□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 ACSL6Q9UKU0 697 aa6.39□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 ERVW-1Q9UQF0 538 aa6.39□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 RNF6Q9Y252 685 aa6.39□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa6.39□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 OR2A25A4D2G3 310 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 TMEM229AB2RXF0 380 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 J3KTA2 159 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 SLCO2B1O94956 709 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 CATP04040 527 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 GSTM1P09488 218 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 HSMCR30P0CW71 290 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 DBTP11182 482 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 HLA-EP13747 358 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 XPAP23025 273 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 IMPA1P29218 277 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 HNF4AP41235 474 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 PRIM2P49643 509 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 HBA1P69905 142 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 SLC7A9P82251 487 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 SPIBQ01892 262 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 KCNC4Q03721 635 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 STARD3Q14849 445 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 ZNF385BQ569K4 471 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 FAHD1Q6P587 224 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 TMEM220Q6QAJ8 160 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 DSG4Q86SJ6 1040 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 PGBD3Q8N328 593 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 MFSD4AQ8N468 514 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 C11orf65Q8NCR3 313 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 NEIL2Q969S2 332 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 LMLNQ96KR4 655 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 FCRL1Q96LA6 429 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 DACH2Q96NX9 599 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 PKP4Q99569 1192 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 TCF25Q9BQ70 676 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 DCSTAMPQ9H295 470 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 OR51B5Q9H339 312 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 ABCB10Q9NRK6 738 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 INIPQ9NRY2 104 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 ATAD3AQ9NVI7 634 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 SPASTQ9UBP0 616 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 TRIM17Q9Y577 477 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 KCNE2Q9Y6J6 123 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 SCN5AQ14524 2016 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 MYO7AQ13402 2215 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 C1orf226A1L170 272 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 TTC34A8MYJ7 566 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 NPIPB8E9PQR5 432 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 H0YIV9 168 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 CCL16O15467 120 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 AIREO43918 545 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 UGDHO60701 494 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 C6orf47O95873 294 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 CXCL10P02778 98 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 C8AP07357 584 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 STSP08842 583 aa6.38□□□□□ -1.39
RAD51B-210ENST00000487270 MAGP20916 626 aa6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms