RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486357.1

APOBEC3G-206, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

TSL 4

Gene APOBEC3G, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-206ENST00000486357 PRSS44E7EML9 344 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 MATN2O00339 956 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 PEX12O00623 359 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 STX16O14662 325 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 LRRTM2O43300 516 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 LDB2O43679 373 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 PTP4A3O75365 173 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 CEACAM4O75871 244 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 JCHAINP01591 159 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 PIRTP0C851 137 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 GPR89BP0CG08 455 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 PRF1P14222 555 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 FERP16591 822 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 CYP2A7P20853 494 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 CD86P42081 329 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 KCNC1P48547 511 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 RPL26P61254 145 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 UBE2HP62256 183 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 TUBB4BP68371 445 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 HSD11B2P80365 405 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 UBXN1Q04323 297 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 TUBB2AQ13885 445 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 KRT33BQ14525 404 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 DPYSL2Q16555 572 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 BAK1Q16611 211 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 PTCHD3Q3KNS1 767 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 KMT5CQ86Y97 462 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 RAB43Q86YS6 212 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 LRRC49Q8IUZ0 686 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 MCEMP1Q8IX19 187 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMEM151AQ8N4L1 468 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZADH2Q8N4Q0 377 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 NKAIN3Q8N8D7 197 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 CLEC1AQ8NC01 280 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCNYQ8ND76 341 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR8K5Q8NH50 307 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 CPT1BQ92523 772 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 GLYATL1Q969I3 302 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 RANBP9Q96S59 729 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 TIMM29Q9BSF4 260 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 TUBB2BQ9BVA1 445 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 NLNQ9BYT8 704 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 TRIM5Q9C035 493 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 RAB33BQ9H082 229 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 CLSTN2Q9H4D0 955 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 HRASLS2Q9NWW9 162 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 NDUFAF4Q9P032 175 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 C5AR2Q9P296 337 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 PSMD13Q9UNM6 376 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 OSGIN2Q9Y236 505 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 SHANK1Q9Y566 2161 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR6C74A6NCV1 312 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 TLCD2A6NGC4 264 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 C9J4A7 227 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 MSTNO14793 375 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 CHUKO15111 745 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 MATN3O15232 486 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 VEGFDO43915 354 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 KLHL41O60662 606 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 URI1O94763 535 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 RASAL1O95294 804 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 RAB40ALP0C0E4 278 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 CDH3P22223 829 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 PCK1P35558 622 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 GJC1P36383 396 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCR9P51686 369 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 NIPAL4Q0D2K0 466 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 GALNT2Q10471 571 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 PRKAA1Q13131 559 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 XRCC4Q13426 336 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 GALNT3Q14435 633 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 RNF151Q2KHN1 245 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 MLIPQ5VWP3 458 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 LCN10Q6JVE6 187 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 WASH2PQ6VEQ5 465 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 DOK3Q7L591 496 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 AMZ2Q86W34 360 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 OOSP2Q86WS3 158 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 DSELQ8IZU8 1212 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 D2HGDHQ8N465 521 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3G-206ENST00000486357 TRAM1L1Q8N609 369 aa6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms