RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474831.5

LAMTOR4-208, Transcript of late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 4, human

TSL 3

Gene LAMTOR4, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZNF225	Q9UK10	706 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TCFL5	Q9UL49	500 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CACNA1B	Q00975	2339 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	C21orf140	B9A014	251 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SMIM24	O75264	130 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	KLHL18	O94889	574 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	HBQ1	P09105	142 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PCNA	P12004	261 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	AGXT	P21549	392 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	GRK3	P35626	688 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	NEK2	P51955	445 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	E2F2	Q14209	437 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	NKG7	Q16617	165 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TBR1	Q16650	682 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	LINC00303	Q3SY05	128 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	DEFB134	Q4QY38	66 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	NT5C	Q8TCD5	201 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TTC9	Q92623	222 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	THAP11	Q96EK4	314 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	DRC3	Q9H069	523 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	IPPK	Q9H8X2	491 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831		C9J4A7	227 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	COPE	O14579	308 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	STX16	O14662	325 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	GLRA3	O75311	464 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	DNAJB5	O75953	348 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ETHE1	O95571	254 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ONECUT2	O95948	504 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	EPB42	P16452	691 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	OTX2	P32243	289 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	UCN	P55089	124 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ATP1A4	Q13733	1029 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	BANP	Q8N9N5	519 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SMIM10	Q96HG1	83 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	F2RL3	Q96RI0	385 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	MECR	Q9BV79	373 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	COPG2	Q9UBF2	871 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	GSTA1	P08263	222 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CRHR1	P34998	444 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	AHR	P35869	848 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CASP2	P42575	452 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	DSG2	Q14126	1118 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PCLAF	Q15004	111 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SYVN1	Q86TM6	617 aa		13.19	□□□□□ -0.3

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