RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472863.5

HOXB3-207, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-207ENST00000472863 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
HOXB3-207ENST00000472863 ZIC1Q15915 447 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXB3-207ENST00000472863 ARMC6Q6NXE6 501 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXB3-207ENST00000472863 SLC2A7Q6PXP3 512 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXB3-207ENST00000472863 ULK2Q8IYT8 1036 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXB3-207ENST00000472863 TBC1D19Q8N5T2 526 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXB3-207ENST00000472863 FAM13CQ8NE31 585 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXB3-207ENST00000472863 SLC39A3Q9BRY0 314 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
HOXB3-207ENST00000472863 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
HOXB3-207ENST00000472863 KLHL31Q9H511 634 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXB3-207ENST00000472863 PACSIN3Q9UKS6 424 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXB3-207ENST00000472863 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXB3-207ENST00000472863 RNF215Q9Y6U7 377 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXB3-207ENST00000472863 HYAL2Q12891 473 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 HKDC1Q2TB90 917 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 SCUBE1Q8IWY4 988 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 FAM9CQ8IZT9 166 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 CDRT15Q96T59 188 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 ABCG4Q9H172 646 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 SLAMF8Q9P0V8 285 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 A0A0J9YY10 115 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 A0A1B0GTQ1 180 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 LILRA5A6NI73 299 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 PHC1P78364 1004 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 DUOXA1Q1HG43 343 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 UBE3DQ7Z6J8 389 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 SLC35F3Q8IY50 421 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 ZUFSPQ96AP4 578 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 AHSPQ9NZD4 102 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 LRIT1Q9P2V4 623 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 POMT2Q9UKY4 750 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 RHPN2P1A8MT19 583 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 NDUFS4O43181 175 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 SEMA3DO95025 777 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 PGRP06401 933 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 PROS1P07225 676 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 PRPS1L1P21108 318 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 BSGP35613 385 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 PSME3P61289 254 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 PLIN5Q00G26 463 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 COQ5Q5HYK3 327 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 TRPV3Q8NET8 790 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 LHX9Q9NQ69 397 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 NDE1Q9NXR1 346 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 PILRAQ9UKJ1 303 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 FRYLO94915 3013 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 A0A0G2JN53 185 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 A0A0J9YVX5 310 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 DYTNA2CJ06 578 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 PDE5AO76074 875 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 IL6P05231 212 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 RAP1GDS1P52306 607 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 PLA2G16P53816 162 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 PGS1Q32NB8 556 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 HACD2Q6Y1H2 254 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 VN1R4Q7Z5H5 301 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 ARHGAP24Q8N264 748 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 ARL10Q8N8L6 244 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 OR7A2PQ8NGA2 310 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 ROPN1LQ96C74 230 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 CROTQ9UKG9 612 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 KLK4Q9Y5K2 254 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 FAM86C2PA6NEL3 165 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 ALDH4A1P30038 563 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 KLHL35Q6PF15 583 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP26.24■■□□□ 1.799e-7■■□□□ 12.2
HOXB3-207ENST00000472863 SLC13A3Q8WWT9 602 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 RGMAQ96B86 450 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 TESCQ96BS2 214 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 OR2A5Q96R48 311 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 GAREM1Q9H706 876 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 CAPN10Q9HC96 672 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 SLC7A8Q9UHI5 535 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 MCM8Q9UJA3 840 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 FXYD1O00168 92 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 PCSK2P16519 638 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 GSTM2P28161 218 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 CAPZBP47756 277 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF763Q0D2J5 394 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 NFYCQ13952 458 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 UGT8Q16880 541 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 IRGCQ6NXR0 463 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 PGM2L1Q6PCE3 622 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXB3-207ENST00000472863 OR2I1PQ8NGU4 316 aa26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms