RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 GALNT16Q8N428 558 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 SNX31Q8N9S9 440 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 TEX19Q8NA77 164 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 OR11G2Q8NGC1 345 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 CREB3L4Q8TEY5 395 aa8.67□□□□□ -1.02
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SYN3-211ENST00000472027 ISL2Q96A47 359 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 VPS50Q96JG6 964 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 GPR78Q96P69 363 aa8.67□□□□□ -1.02
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SYN3-211ENST00000472027 NT5DC2Q9H857 520 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 C14orf105Q9NVL8 296 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 GPR83Q9NYM4 423 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 NUDT4Q9NZJ9 180 aa8.67□□□□□ -1.02
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SYN3-211ENST00000472027 ZNF180Q9UJW8 692 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 ANAPC2Q9UJX6 822 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 FBXL4Q9UKA2 621 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
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SYN3-211ENST00000472027 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 CCDC189A1A4V9 331 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 URADA6NGE7 173 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
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SYN3-211ENST00000472027 ALOX12BO75342 701 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 RDH16O75452 317 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 JRKO75564 520 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 KRT38O76015 456 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 KLHL18O94889 574 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 B3GALT4O96024 378 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 SERPINA6P08185 405 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 ABHD2P08910 425 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 SMIM10L1P0DMW3 83 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 ALOX12P18054 663 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 EPORP19235 508 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 CNTFP26441 200 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 GCAP28676 217 aa8.66□□□□□ -1.02
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SYN3-211ENST00000472027 AGTR2P50052 363 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 RAB8AP61006 207 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 DOC2AQ14183 400 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 SLC29A2Q14542 456 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 MYBPC3Q14896 1274 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 HERC3Q15034 1050 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 PDK4Q16654 411 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 DEFB134Q4QY38 66 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 XKR6Q5GH73 641 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 COLEC12Q5KU26 742 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 TEX35Q5T0J7 233 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 LGSNQ5TDP6 509 aa8.66□□□□□ -1.02
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SYN3-211ENST00000472027 ABHD13Q7L211 337 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 TAOK1Q7L7X3 1001 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa8.66□□□□□ -1.02
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SYN3-211ENST00000472027 TTLQ8NG68 377 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 OR5T3Q8NGG3 340 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 C8orf44Q96CB5 159 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 WDR34Q96EX3 536 aa8.66□□□□□ -1.02
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SYN3-211ENST00000472027 PEX11GQ96HA9 241 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 SMIM10Q96HG1 83 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 TXLNGYQ9BZA5 131 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 SLC6A16Q9GZN6 736 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 EHD1Q9H4M9 534 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 ZNF358Q9NW07 568 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 HCN3Q9P1Z3 774 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 MKL2Q9ULH7 1088 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 FAM208BQ5VWN6 2430 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 FER1L5A0AVI2 2057 aa8.66□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 CACNA1GO43497 2377 aa8.65□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 BSNQ9UPA5 3926 aa8.65□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa8.65□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 OR2W5A6NFC9 320 aa8.65□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 ZNF860A6NHJ4 632 aa8.65□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 ANKDD1BA6NHY2 528 aa8.65□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 TRIM49D1C9J1S8 452 aa8.65□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 J3QKU1 62 aa8.65□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 K7EPI3 171 aa8.65□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 PCDH17O14917 1159 aa8.65□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 KLK8O60259 260 aa8.65□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 KLHL41O60662 606 aa8.65□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 HPP00738 406 aa8.65□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
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