RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	LNP1	A1A4G5	178 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	TXNDC9	O14530	226 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	HAT1	O14929	419 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	DUX1	O43812	170 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	GDF9	O60383	454 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	CTSV	O60911	334 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	MYO1D	O94832	1006 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	UNC5C	O95185	931 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	GP1BA	P07359	652 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	TYRP1	P17643	537 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	PIK3R1	P27986	724 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	GRK6	P43250	576 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	RASSF2	P50749	326 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	EMP3	P54852	163 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	OR1D5	P58170	312 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	STX1B	P61266	288 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	HYAL2	Q12891	473 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	RPS6KA2	Q15349	733 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	COQ5	Q5HYK3	327 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	SPRED1	Q7Z699	444 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	RGMA	Q96B86	450 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	SMIM10	Q96HG1	83 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	CENPK	Q9BS16	269 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	C1orf21	Q9H246	121 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	ACTL8	Q9H568	366 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	ARMCX1	Q9P291	453 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	MCM8	Q9UJA3	840 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	FEZF1	A0PJY2	475 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM234B	A2RU67	622 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	URAD	A6NGE7	173 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC30A4	O14863	429 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	FLRT2	O43155	660 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC22A3	O75751	556 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	SCEL	O95171	688 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	TGFB1	P01137	390 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	G6PD	P11413	515 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	ALDH4A1	P30038	563 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	BSG	P35613	385 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	ASMT	P46597	345 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	GABRA4	P48169	554 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	CFHR1	Q03591	330 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	STX5	Q13190	355 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	ADCK2	Q7Z695	626 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	ASPG	Q86U10	573 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	EID2	Q8N6I1	236 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	OR2L5	Q8NG80	312 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	STARD8	Q92502	1023 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	OR51B5	Q9H339	312 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	TBX19	O60806	448 aa		12.16	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	KIAA0754	O94854	1291 aa		12.16	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	KLHL18	O94889	574 aa		12.16	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	NPPA	P01160	153 aa		12.16	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	12.16	□□□□□ -0.46
TRAF4-208	ENST00000469529	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		12.16	□□□□□ -0.46

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