RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469025.1

OPTN-209, Transcript of optineurin, humanhuman

TSL 3

Gene OPTN, Length 642 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTN-209ENST00000469025 BCO1Q9HAY6 547 aa4.77□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 SLC40A1Q9NP59 571 aa4.77□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 PCDH12Q9NPG4 1184 aa4.77□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 ANKRD10Q9NXR5 420 aa4.77□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.77□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 NINQ8N4C6 2090 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 A0A1B0GUS0 222 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 TSPAN11A1L157 253 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 YJEFN3A6XGL0 299 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 K7ENM7 598 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 DHHO43323 396 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 AKR1B10O60218 316 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 SNX2O60749 519 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 CTSVO60911 334 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 CLDN11O75508 207 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 SLC25A12O75746 678 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 ZMPSTE24O75844 475 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 SPDEFO95238 335 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 LDHAP00338 332 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 OPN1MWP04001 364 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 SLC35E2P0CK97 266 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 OPN1MW2P0DN77 364 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 OPN1MW3P0DN78 364 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 DPP4P27487 766 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 ECHS1P30084 290 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 PCYT1AP49585 367 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 SEC24CP53992 1094 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 PDE1AP54750 535 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 GYS2P54840 703 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 CDH15P55291 814 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 CDK17Q00537 523 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 SP140Q13342 867 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 NFIL3Q16649 462 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 UGP2Q16851 508 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 DEFB121Q5J5C9 76 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 MANEALQ5VSG8 457 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 DOK6Q6PKX4 331 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 SATL1Q86VE3 508 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 RHOT2Q8IXI1 618 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 OR2AP1Q8NGE2 309 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 OR56A1Q8NGH5 318 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 CAVIN3Q969G5 261 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 C8orf44Q96CB5 159 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 BTN2A3PQ96KV6 586 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 GSDMAQ96QA5 445 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 TRIM54Q9BYV2 358 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 ASB8Q9H765 288 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 HMGXB4Q9UGU5 601 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 DDX19BQ9UMR2 479 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 KCNK6Q9Y257 313 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 RNF213Q63HN8 5207 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 NCKAP5O14513 1909 aa4.76□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 A0A1B0GVC2 190 aa4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 VSTM2BA6NLU5 285 aa4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 VWC2LB2RUY7 222 aa4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 E9PMD0 336 aa4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 NEMFO60524 1076 aa4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 CD160O95971 181 aa4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 IGHG3P01860 377 aa4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 CSF3P09919 207 aa4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 ICAM2P13598 275 aa4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 MTHFD2P13995 350 aa4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 UGT1A1P22309 533 aa4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 ATICP31939 592 aa4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 OPRM1P35372 400 aa4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 RFC3P40938 356 aa4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 CLK3P49761 638 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 CLCNKAP51800 687 aa4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 ADARP55265 1226 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 FOXI1Q12951 378 aa4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 RALGDSQ12967 914 aa4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 ADRM1Q16186 407 aa4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 MUM1Q2TAK8 710 aa4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 ADAM5Q6NVV9 412 aa4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 H3F3CQ6NXT2 135 aa4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 Q6ZVL8 140 aa4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 DRC7Q8IY82 874 aa4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 ZPLD1Q8TCW7 415 aa4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 FATE1Q969F0 183 aa4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 SAAL1Q96ER3 474 aa4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 SERPINB11Q96P15 392 aa4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 TMEM204Q9BSN7 226 aa4.75□□□□□ -1.65
OPTN-209ENST00000469025 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.9 ms