RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436287.1

ACTBP11-201, Transcript of actin, beta pseudogene 11, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP11, Length 1,126 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP11-201ENST00000436287 MED16Q9Y2X0 877 aa14□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 HRH3Q9Y5N1 445 aa14□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 GTF3C1Q12789 2109 aa14□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 FOXO6A8MYZ6 492 aa13.99□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 MPC1LP0DKB6 136 aa13.99□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 PTMSP20962 102 aa13.99□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 COILP38432 576 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 ART1P52961 327 aa13.99□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 MLF1P58340 268 aa13.99□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 TFF3Q07654 80 aa13.99□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 KIF5AQ12840 1032 aa13.99□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 SEL1L2Q5TEA6 688 aa13.99□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 TMEM211Q6ICI0 200 aa13.99□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 NEPROQ6NW34 567 aa13.99□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 C4orf22Q6V702 233 aa13.99□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 ASPGQ86U10 573 aa13.99□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC26A11Q86WA9 606 aa13.99□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 SPNS2Q8IVW8 549 aa13.99□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 KIF2BQ8N4N8 673 aa13.99□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 MARVELD2Q8N4S9 558 aa13.99□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa13.99□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 ASB5Q8WWX0 329 aa13.99□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 TMEM125Q96AQ2 219 aa13.99□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 RBCK1Q9BYM8 510 aa13.99□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa13.99□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP13.99□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 A0A1B0GTH9 108 aa13.98□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 FEZF1A0PJY2 475 aa13.98□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 TOXO94900 526 aa13.98□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 HLCSP50747 726 aa13.98□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 BASP1P80723 227 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 CDK16Q00536 496 aa13.98□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 CUL1Q13616 776 aa13.98□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 CEP128Q6ZU80 1094 aa13.98□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 CD163Q86VB7 1156 aa13.98□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 ARMC10Q8N2F6 343 aa13.98□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa13.98□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 OR5T3Q8NGG3 340 aa13.98□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 KCNJ9Q92806 393 aa13.98□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 TBC1D20Q96BZ9 403 aa13.98□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 TSGA10Q9BZW7 698 aa13.98□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 PCBD2Q9H0N5 130 aa13.98□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 DHRS7Q9Y394 339 aa13.98□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF860A6NHJ4 632 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 TFECO14948 347 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 TPOP07202 933 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 FHP07954 510 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 MSX1P28360 303 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 CHRNB4P30926 498 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 ITGA8P53708 1063 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 TBPL1P62380 186 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 HERC3Q15034 1050 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 CCNG2Q16589 344 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 CMPK2Q5EBM0 449 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 ARMC3Q5W041 872 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF549Q6P9A3 640 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 C17orf64Q86WR6 236 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 SULF2Q8IWU5 870 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 C16orf52Q8NHV5 167 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 TMUB1Q9BVT8 246 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 UCK2Q9BZX2 261 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 KCNJ16Q9NPI9 418 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 SH2B3Q9UQQ2 575 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 RNF6Q9Y252 685 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 ACANP16112 2415 aa13.96□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 FAM221AA4D161 298 aa13.96□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 NKX2-6A6NCS4 301 aa13.96□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa13.96□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 CHST10O43529 356 aa13.96□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 HS6ST1O60243 411 aa13.96□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 DNAJB6O75190 326 aa13.96□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 NADKO95544 446 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC35G6P0C7Q6 338 aa13.96□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 CD99P14209 185 aa13.96□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 PAMP19021 973 aa13.96□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 TFEBP19484 476 aa13.96□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 JAK1P23458 1154 aa13.96□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 MEOX1P50221 254 aa13.96□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 TXLNBQ8N3L3 684 aa13.96□□□□□ -0.17
ACTBP11-201ENST00000436287 MFSD9Q8NBP5 474 aa13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.5 ms