RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 FCRLBQ6BAA4 426 aa6.19□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF425Q6IV72 752 aa6.19□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 LRRC8BQ6P9F7 803 aa6.19□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM207Q6UWW9 146 aa6.19□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa6.19□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 LANCL3Q6ZV70 420 aa6.19□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 GDF7Q7Z4P5 450 aa6.19□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 ASB11Q8WXH4 323 aa6.19□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 FAM136AQ96C01 138 aa6.19□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 CABS1Q96KC9 395 aa6.19□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 BIRC8Q96P09 236 aa6.19□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 OR2A5Q96R48 311 aa6.19□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 NPAS2Q99743 824 aa6.19□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 PLCD4Q9BRC7 762 aa6.19□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa6.19□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 HES7Q9BYE0 225 aa6.19□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 RNF32Q9H0A6 362 aa6.19□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 TREX1Q9NSU2 369 aa6.19□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 CATSPERZQ9NTU4 200 aa6.19□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 TRPC4Q9UBN4 977 aa6.19□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 SEC14L3Q9UDX4 400 aa6.19□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 TINAGQ9UJW2 476 aa6.19□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa6.19□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 PYCARDQ9ULZ3 195 aa6.19□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 OR5H15A6NDH6 313 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 LIASO43766 372 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 NIPSNAP2O75323 286 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 MATN4O95460 622 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 HEXBP07686 556 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 COX6B1P14854 86 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 FDXRP22570 491 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 CETN2P41208 172 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 PRAMEP78395 509 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 TMED2Q15363 201 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 ACSBG2Q5FVE4 666 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 CES3Q6UWW8 571 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 NEK10Q6ZWH5 1172 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 PRSS41Q7RTY9 318 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 PLD3Q8IV08 490 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 CSNK1A1LQ8N752 337 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 PPFIBP2Q8ND30 876 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 DNAJB8Q8NHS0 232 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 VPS50Q96JG6 964 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 PANX2Q96RD6 677 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 PKP4Q99569 1192 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 TTC1Q99614 292 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 TSSK1BQ9BXA7 367 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 C14orf105Q9NVL8 296 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 SPATA7Q9P0W8 599 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 AMFRQ9UKV5 643 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF835Q9Y2P0 537 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 C2CD3Q4AC94 2353 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 POLQO75417 2590 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa6.17□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 GOLGA8KD6RF30 607 aa6.17□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.17□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 F8W8V4 182 aa6.17□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 GOLGA8TH3BQL2 631 aa6.17□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 MYO1CO00159 1063 aa6.17□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 HAT1O14929 419 aa6.17□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 SLC19A2O60779 497 aa6.17□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 IFNB1P01574 187 aa6.17□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 CRYABP02511 175 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 ERVK-10P10266 1014 aa6.17□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 HOXA5P20719 270 aa6.17□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 CXCR2P25025 360 aa6.17□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 CMPK1P30085 196 aa6.17□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 FMO4P31512 558 aa6.17□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 RPL22P35268 128 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 FDFT1P37268 417 aa6.17□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 TTPAP49638 278 aa6.17□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 CCZ1BP86790 482 aa6.17□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF33BQ06732 778 aa6.17□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 SNX1Q13596 522 aa6.17□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 KCNJ11Q14654 390 aa6.17□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF766Q5HY98 468 aa6.17□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 PCID2Q5JVF3 399 aa6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms