RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 CLIC1O00299 241 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CXCR6O00574 342 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 YY2O15391 372 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ST8SIA5O15466 376 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PRMT3O60678 531 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SCN2BO60939 215 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 LDLRP01130 860 aa3.82□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 FCGR1AP12314 374 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ACPPP15309 386 aa3.82□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 ENGP17813 658 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 DRD1P21728 446 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 IDSP22304 550 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ACSL1P33121 698 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ASMTP46597 345 aa3.82□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 E2F2Q14209 437 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 GK3PQ14409 553 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CLCA4Q14CN2 919 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 FXNQ16595 210 aa3.82□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM164Q5U3C3 297 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 IYDQ6PHW0 289 aa3.82□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 COMMD6Q7Z4G1 85 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ADCK2Q7Z695 626 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PLD3Q8IV08 490 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM20CQ8IXL6 584 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 LAS2Q8IYD9 372 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 MICU2Q8IYU8 434 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 TBC1D21Q8IYX1 336 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 KRT78Q8N1N4 520 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC44A3Q8N4M1 653 aa3.82□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 VPS37AQ8NEZ2 397 aa3.82□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 DNAJB8Q8NHS0 232 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 UBE2E3Q969T4 207 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 WDR34Q96EX3 536 aa3.82□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 VPS50Q96JG6 964 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 MRGPRX1Q96LB2 322 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa3.82□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 SPASTQ9UBP0 616 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CD207Q9UJ71 328 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 OAZ3Q9UMX2 235 aa3.82□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 GON4LQ3T8J9 2241 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 KNL1Q8NG31 2342 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa3.82□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 A6NHS1 94 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 GPR89AB7ZAQ6 455 aa3.82□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 TRPC1P48995 793 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 TAS2R50P59544 299 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PHEXP78562 749 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 TFF2Q03403 129 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 C2orf80Q0P641 193 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 MTAPQ13126 283 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC14A1Q13336 389 aa3.82□□□□□ -1.8
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