RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 BTBD1Q9H0C5 482 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 TECPR2O15040 1411 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 FAM170BA6NMN3 283 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 C1orf196B1AJZ1 125 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 STK25O00506 426 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 XKRYO14609 159 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 KMOO15229 486 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 EEDO75530 441 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 CDK14O94921 469 aa9.5□□□□□ -0.89
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HERC3-202ENST00000402738 CRISP3P54108 245 aa9.5□□□□□ -0.89
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HERC3-202ENST00000402738 NEK7Q8TDX7 302 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 TCEAL3Q969E4 200 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 ELMOD3Q96FG2 381 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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HERC3-202ENST00000402738 YIPF4Q9BSR8 244 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 H3BSH0 61 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 SGCEO43556 437 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 RPP14O95059 124 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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HERC3-202ENST00000402738 THEGLP0DJG4 465 aa9.5□□□□□ -0.89
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HERC3-202ENST00000402738 RORAP35398 523 aa9.5□□□□□ -0.89
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HERC3-202ENST00000402738 RANBP9Q96S59 729 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 OR51E2Q9H255 320 aa9.5□□□□□ -0.89
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HERC3-202ENST00000402738 S100GP29377 79 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 OR3A3P47888 321 aa9.5□□□□□ -0.89
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HERC3-202ENST00000402738 SLC30A8Q8IWU4 369 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 HS3ST5Q8IZT8 346 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 HDDC3Q8N4P3 179 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 PARP16Q8N5Y8 322 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 OR10H5Q8NGA6 315 aa9.5□□□□□ -0.89
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HERC3-202ENST00000402738 KIAA1191Q96A73 305 aa9.5□□□□□ -0.89
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HERC3-202ENST00000402738 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 NTN4Q9HB63 628 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 OR2S2Q9NQN1 319 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 RNF11Q9Y3C5 154 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 CD8B2A6NJW9 211 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 FLRT2O43155 660 aa9.49□□□□□ -0.89
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HERC3-202ENST00000402738 SPARCP09486 303 aa9.49□□□□□ -0.89
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HERC3-202ENST00000402738 KELP23276 732 aa9.49□□□□□ -0.89
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HERC3-202ENST00000402738 GINS1Q14691 196 aa9.49□□□□□ -0.89
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HERC3-202ENST00000402738 FBXL18Q96ME1 805 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 FRG2BQ96QU4 278 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 TTLL2Q9BWV7 592 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 TTTY10Q9BZA0 68 aa9.49□□□□□ -0.89
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