RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 C3orf30Q96M34 536 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 FRMD6Q96NE9 622 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 IKZF2Q9UKS7 526 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 TAF1P21675 1872 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 GJB5O95377 273 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 PRAMEF12O95522 483 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 HNF1BP35680 557 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 GRM2Q14416 872 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 KCTD11Q693B1 232 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 GALNT7Q86SF2 657 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 TCEANCQ8N8B7 351 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 CLIP3Q96DZ5 547 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 NUS1Q96E22 293 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 POLE4Q9NR33 117 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 C7orf72A4D263 438 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC25A12O75746 678 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 DNTTP04053 509 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 MPC1LP0DKB6 136 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 DCDC1P59894 354 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 CD83Q01151 205 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 HSF2Q03933 536 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 LETMD1Q6P1Q0 360 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 PRSS48Q7RTY5 328 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 TMC8Q8IU68 726 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC5A11Q8WWX8 675 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 ZFP3Q96NJ6 502 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 ERVW-1Q9UQF0 538 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 CA12O43570 354 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 PRSS56P0CW18 603 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 BMXP51813 675 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 PITPNAQ00169 270 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 RHAGQ02094 409 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 MGLLQ99685 303 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 IFT27Q9BW83 186 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa15.83■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa15.83■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 TBC1D3EA0A087X179 549 aa15.83■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa15.83■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A0G2JN53 185 aa15.83■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 WASH4PA8MWX3 477 aa15.83■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 TBC1D3LB9A6J9 549 aa15.83■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 LDB2O43679 373 aa15.83■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 HCN1O60741 890 aa15.83■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 KLHL18O94889 574 aa15.83■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 TBC1D3HP0C7X1 549 aa15.83■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 JUPP14923 745 aa15.83■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 AVPR1BP47901 424 aa15.83■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa15.83■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa15.83■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa15.83■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 SCD5Q86SK9 330 aa15.83■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 LSMEM2Q8N112 164 aa15.83■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 VMP1Q96GC9 406 aa15.83■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 CMAHPQ9Y471 501 aa15.83■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 OAZ2O95190 189 aa15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2-201ENST00000398073 GBAP04062 536 aa15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2-201ENST00000398073 C12orf66Q96MD2 445 aa15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2-201ENST00000398073 MGME1Q9BQP7 344 aa15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2-201ENST00000398073 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2-201ENST00000398073 PFDN2Q9UHV9 154 aa15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2-201ENST00000398073 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2-201ENST00000398073 ARNTLO00327 626 aa15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2-201ENST00000398073 CNMDO75829 334 aa15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2-201ENST00000398073 PEPDP12955 493 aa15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2-201ENST00000398073 MAGEA8P43361 318 aa15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2-201ENST00000398073 RELAQ04206 551 aa15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2-201ENST00000398073 MEDAGQ5VYS4 303 aa15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2-201ENST00000398073 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2-201ENST00000398073 LRRTM3Q86VH5 581 aa15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2-201ENST00000398073 ISL2Q96A47 359 aa15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2-201ENST00000398073 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2-201ENST00000398073 TAS2R9Q9NYW1 312 aa15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2-201ENST00000398073 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2-201ENST00000398073 HMX2A2RU54 273 aa15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2-201ENST00000398073 M0QZQ0 153 aa15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2-201ENST00000398073 SERPINA3P01011 423 aa15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2-201ENST00000398073 RB1P06400 928 aa15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2-201ENST00000398073 GKP32189 559 aa15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2-201ENST00000398073 NCS1P62166 190 aa15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2-201ENST00000398073 CRHR2Q13324 411 aa15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2-201ENST00000398073 SYCE2Q6PIF2 218 aa15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2-201ENST00000398073 CD200R1Q8TD46 325 aa15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2-201ENST00000398073 SMPDL3AQ92484 453 aa15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2-201ENST00000398073 DSN1Q9H410 356 aa15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2-201ENST00000398073 IL36AQ9UHA7 158 aa15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2-201ENST00000398073 SPO11Q9Y5K1 396 aa15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms