RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393203.2

PTGFRN-201, Transcript of prostaglandin F2 receptor inhibitor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGFRN, Length 6,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRN-201ENST00000393203 FAM217AQ8IXS0 508 aa14.77□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 CYTH4Q9UIA0 394 aa14.77□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 HCN2Q9UL51 889 aa14.77□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 OAZ2O95190 189 aa14.77□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 HMGN1P05114 100 aa14.77□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 C6orf141Q5SZD1 244 aa14.77□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 RELL1Q8IUW5 271 aa14.77□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 PHC3Q8NDX5 983 aa14.77□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa14.77□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 TRIM36Q9NQ86 728 aa14.77□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 LCHNA4D1U4 455 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 GRXCR1A8MXD5 290 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 MT-ND2P03891 347 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 CLCNKAP51800 687 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ERVK-21P61565 698 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 TUBA3CQ13748 450 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ADGRF1Q5T601 910 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 TAS1R3Q7RTX0 852 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 FAM46DQ8NEK8 389 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 OR5J2Q8NH18 312 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 RBPJLQ9UBG7 517 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ALG5Q9Y673 324 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 A0A1B0GVG6 124 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 VILLO15195 856 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 RAB36O95755 333 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 TMBIM6P55061 237 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ENPP6Q6UWR7 440 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 METTL21AQ8WXB1 218 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 MSANTD3Q96H12 275 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 FAXDC2Q96IV6 333 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 CCM2Q9BSQ5 444 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 PCBD2Q9H0N5 130 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 NUDT15Q9NV35 164 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 HLA-DPB1P04440 258 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 INHBEP58166 350 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ID2Q02363 134 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 NCEH1Q6PIU2 408 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 WDTC1Q8N5D0 677 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF350Q9GZX5 532 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF20P17024 532 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 OR4D2P58180 307 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 DNAJB13P59910 316 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ABCA11PQ4W5N1 156 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 POGLUT1Q8NBL1 392 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 FNDC8Q8TC99 324 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 CAMK1GQ96NX5 476 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 MOCS1Q9NZB8 636 aa14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 MATN1P21941 496 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 PMS2P3Q13401 168 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ALG1LQ6GMV1 187 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 TP53INP2Q8IXH6 220 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 SCML4Q8N228 414 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 PNPLA1Q8N8W4 532 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF778Q96MU6 729 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 NPY6RQ99463 290 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 HERPUD2Q9BSE4 406 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 TMEM44Q2T9K0 475 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 TMEM151AQ8N4L1 468 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 OR51G2Q8NGK0 314 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 SPAG16Q8N0X2 631 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ITFG2Q969R8 447 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ERVW-1Q9UQF0 538 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 EBLN1P0CF75 366 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC35E2BP0CK96 405 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 CDKN2DP55273 166 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 TMEM53Q6P2H8 277 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 NUP54Q7Z3B4 507 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 TIGD4Q8IY51 512 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF101Q8IZC7 436 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 OR52E4Q8NGH9 312 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 GAL3ST3Q96A11 431 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF599Q96NL3 588 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 EFCAB11Q9BUY7 163 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ALKBH4Q9NXW9 302 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 EXTL2Q9UBQ6 330 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 BEST1O76090 585 aa14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms