RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 FDXRP22570 491 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 KCNAB2Q13303 367 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ADNP2Q6IQ32 1131 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 MAPK15Q8TD08 544 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 PIK3R3Q92569 461 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 IL17FQ96PD4 163 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 TCF7L1Q9HCS4 588 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 TM9SF3Q9HD45 589 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 GIN1Q9NXP7 522 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 OARD1Q9Y530 152 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 INMTO95050 263 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 TNFP01375 233 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 RFC2P35250 354 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 ARL9Q6T311 187 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 MED28Q9H204 178 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 DSN1Q9H410 356 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A0U1RQS6 177 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 CPED1A4D0V7 1026 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 CCKBRP32239 447 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 TPTEP56180 551 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 REEP3Q6NUK4 255 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 C17orf99Q6UX52 265 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 RAD9AQ99638 391 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 KCNH6Q9H252 994 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 MYH15Q9Y2K3 1946 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 ANXA2P2A6NMY6 339 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 TTC34A8MYJ7 566 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 CD2P06729 351 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 GSTM3P21266 225 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 GSCP56915 257 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 SPRED3Q2MJR0 410 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 TYSND1Q2T9J0 566 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 NUP54Q7Z3B4 507 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 TSPAN33Q86UF1 283 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 NKD1Q969G9 470 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 BOCQ9BWV1 1114 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 SNNO75324 88 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 SMSP52788 366 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 MC1RQ01726 317 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 GFOD2Q3B7J2 385 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 XKR4Q5GH76 650 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 KLHL36Q8N4N3 616 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 COMMD4Q9H0A8 199 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 PLEKHA1Q9HB21 404 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF860A6NHJ4 632 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 AGR2O95994 175 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 IL4RP24394 825 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 GJA5P36382 358 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 TSTQ16762 297 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 HSDL2Q6YN16 418 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 C3orf58Q8NDZ4 430 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 PJA1Q8NG27 643 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 DGAT2Q96PD7 388 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 BACE2Q9Y5Z0 518 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 MATN1P21941 496 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 KCNA5P22460 613 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 ST3GAL3Q11203 375 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 ENPP2Q13822 863 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 KCNC3Q14003 757 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 TLR1Q15399 786 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC116Q8IYX3 515 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 KCTD7Q96MP8 289 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 TSSK6Q9BXA6 273 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 XPNPEP2O43895 674 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 CYBAP13498 195 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 MVKQ03426 396 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 LIPJQ5W064 366 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP16.63■□□□□ 0.254e-17■■■■■ 54.8
SH3BP4-202ENST00000392011 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 ITPAQ9BY32 194 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 ERVK-11Q9UQG0 969 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 WDR45Q9Y484 360 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 SPO11Q9Y5K1 396 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 M0QZQ0 153 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 BCAP31P51572 246 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 OR4D2P58180 307 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 DOC2AQ14183 400 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 MARCH9Q86YJ5 346 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 MCEMP1Q8IX19 187 aa16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms