RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A0J9YVX5 310 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A1W2PQM1 296 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 TLCD2A6NGC4 264 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 C4orf47A7E2U8 309 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 SERPIND1P05546 499 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 ERVK-8P63133 956 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 CUL3Q13618 768 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 GSTA3Q16772 222 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 AGKQ53H12 422 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 GK5Q6ZS86 529 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 C10orf67Q8IYJ2 551 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 MFSD9Q8NBP5 474 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 CREB3L4Q8TEY5 395 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 PPP3R2Q96LZ3 170 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 RTKNQ9BST9 563 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR51B5Q9H339 312 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 LRTM1Q9HBL6 345 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM60AQ9NP50 221 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 UNC13CQ8NB66 2214 aa26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 SEC22BO75396 215 aa26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 RASSF9O75901 435 aa26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 C9P02748 559 aa26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 IDO1P14902 403 aa26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 CKMT2P17540 419 aa26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 GPX3P22352 226 aa26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 FNDC5Q8NAU1 212 aa26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 TTLQ8NG68 377 aa26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 APIPQ96GX9 242 aa26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 CD180Q99467 661 aa26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 MACROD1Q9BQ69 325 aa26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 C1orf50Q9BV19 199 aa26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC167Q9P0B6 97 aa26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 FTSJ1Q9UET6 329 aa26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 GDF9O60383 454 aa26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 AHRP35869 848 aa26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 CPOXP36551 454 aa26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 DNAL1Q4LDG9 190 aa26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 SNAP47Q5SQN1 464 aa26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 PAOXQ6QHF9 649 aa26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 NAXDQ8IW45 347 aa26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 MIER2Q8N344 545 aa26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 MCUR1Q96AQ8 359 aa26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR2A5Q96R48 311 aa26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 LRRN3Q9H3W5 708 aa26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 C1orf109Q9NX04 203 aa26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 SAP18O00422 153 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRPH2P23942 346 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 SERPINB1P30740 379 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 DIO3P55073 304 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPL38P63173 70 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC25A3Q00325 362 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAPRE2Q15555 327 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 CACHD1Q5VU97 1274 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 FRMPD2BQ6IN97 320 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 CMTM7Q96FZ5 175 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 MS4A8Q9BY19 250 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 AIG1Q9NVV5 245 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 MUC6Q6W4X9 2439 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 CLEC3AO75596 197 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 ACADVLP49748 655 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 NME5P56597 212 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 RELAQ04206 551 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 SQSTM1Q13501 440 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 KIAA0040Q15053 153 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPS6KA2Q15349 733 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 RNF44Q7L0R7 432 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 VN1R4Q7Z5H5 301 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR9I1Q8NGQ6 314 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 PPT2Q9UMR5 302 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 GPR45Q9Y5Y3 372 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 NDUFS4O43181 175 aa26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 HCRTR1O43613 425 aa26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM71Q6P5X7 295 aa26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZFAND4Q86XD8 727 aa26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR4N4Q8N0Y3 316 aa26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRPV3Q8NET8 790 aa26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 F2RL3Q96RI0 385 aa26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 A8MU76 341 aa26.46■■□□□ 1.83
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