RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 OR10G2Q8NGC3 310 aa20.98■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 TRPM4Q8TD43 1214 aa20.98■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 PSKH2Q96QS6 385 aa20.98■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa20.98■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa20.98■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 GALNT9Q9HCQ5 603 aa20.98■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 FNIP2Q9P278 1114 aa20.98■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 GINS2Q9Y248 185 aa20.98■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 HCN1O60741 890 aa20.98■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 ULK1O75385 1050 aa20.98■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 WSCD2Q2TBF2 565 aa20.98■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 XKR4Q5GH76 650 aa20.98■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 CTSL3PQ5NE16 218 aa20.98■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 NOTUMQ6P988 496 aa20.98■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa20.98■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 PSMG2Q969U7 264 aa20.98■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa20.98■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa20.98■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 HS3ST4Q9Y661 456 aa20.98■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 H3BUI4 141 aa20.97■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 TNFRSF11BO00300 401 aa20.97■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 CDRT1O95170 752 aa20.97■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 PRLP01236 227 aa20.97■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 GPX2P18283 190 aa20.97■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 ABATP80404 500 aa20.97■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 ANKRD54Q6NXT1 300 aa20.97■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 RNF39Q9H2S5 420 aa20.97■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 PPT2Q9UMR5 302 aa20.97■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 PADI2Q9Y2J8 665 aa20.97■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa20.97■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 CLIC1O00299 241 aa20.97■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 FABP7O15540 132 aa20.97■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 NAT2P11245 290 aa20.97■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 ANXA8P13928 327 aa20.97■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 WEE1P30291 646 aa20.97■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 MZT2BQ6NZ67 158 aa20.97■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 HSDL2Q6YN16 418 aa20.97■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa20.97■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 CLDN22Q8N7P3 220 aa20.97■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.97■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 IL1AP01583 271 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 EPOP01588 193 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 SGO1Q5FBB7 561 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 DDI2Q5TDH0 399 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 AFTPHQ6ULP2 937 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 COMMD7Q86VX2 200 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 OR10Z1Q8NGY1 313 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 SEMA3CQ99985 751 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 NDUFB11Q9NX14 153 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 ZNF224Q9NZL3 707 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 OGDHLQ9ULD0 1010 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 TMEM229AB2RXF0 380 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 WWP2O00308 870 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 TOR1AO14656 332 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 PCDH17O14917 1159 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 NDUFA2O43678 99 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 ORC5O43913 435 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 PLOD3O60568 738 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 ENGP17813 658 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 HSPA7P48741 367 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 BAMBIQ13145 260 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 FLYWCH1Q4VC44 716 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 SBSNQ6UWP8 590 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 ARSKQ6UWY0 536 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 GPAT4Q86UL3 456 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 TRIM69Q86WT6 500 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 GHDCQ8N2G8 530 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 C19orf18Q8NEA5 215 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 RTP3Q9BQQ7 232 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 TMLHEQ9NVH6 421 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN3-201ENST00000366554 RAF1P04049 648 aa20.95■□□□□ 0.94
OPN3-201ENST00000366554 PIPP12273 146 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
OPN3-201ENST00000366554 APEX1P27695 318 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
OPN3-201ENST00000366554 DSC3Q14574 896 aa20.95■□□□□ 0.94
OPN3-201ENST00000366554 SPHARQ15513 63 aa20.95■□□□□ 0.94
OPN3-201ENST00000366554 ZNF628Q5EBL2 1059 aa20.95■□□□□ 0.94
OPN3-201ENST00000366554 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
OPN3-201ENST00000366554 KLHL17Q6TDP4 642 aa20.95■□□□□ 0.94
OPN3-201ENST00000366554 TESCQ96BS2 214 aa20.95■□□□□ 0.94
OPN3-201ENST00000366554 SMARCD1Q96GM5 515 aa20.95■□□□□ 0.94
OPN3-201ENST00000366554 SAMD11Q96NU1 681 aa20.95■□□□□ 0.94
OPN3-201ENST00000366554 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
OPN3-201ENST00000366554 PRR23AA6NEV1 266 aa20.95■□□□□ 0.94
OPN3-201ENST00000366554 LYRM1O43325 122 aa20.95■□□□□ 0.94
OPN3-201ENST00000366554 CCNB2O95067 398 aa20.95■□□□□ 0.94
OPN3-201ENST00000366554 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.1 ms