RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 SMARCD3Q6STE5 483 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF627Q7L945 461 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 MS4A15Q8N5U1 240 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 NAT8LQ8N9F0 302 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 NRG4Q8WWG1 115 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 KREMEN1Q96MU8 473 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ATG10Q9H0Y0 220 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 PRDM12Q9H4Q4 367 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 GLOD4Q9HC38 313 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 MAFFQ9ULX9 164 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ATG4BQ9Y4P1 393 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 TRAV6A0A075B6T7 132 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM150BA6NC51 233 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 OIP5O43482 229 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 PKMP14618 531 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ST3GAL3Q11203 375 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 GLT8D1Q68CQ7 371 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC30A6Q6NXT4 461 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF584Q8IVC4 421 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 PLD5Q8N7P1 536 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 TIGARQ9NQ88 270 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ANKRD33BA6NCL7 494 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 PIP5K1BO14986 540 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 CLIC3O95833 236 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 IL1R1P14778 569 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ARSFP54793 590 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 SNTA1Q13424 505 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 C9orf64Q5T6V5 341 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 CEP97Q8IW35 865 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 CRYBG2Q8N1P7 616 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 PYURFQ96I23 114 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 KCNC2Q96PR1 638 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF416Q9BWM5 594 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF175Q9Y473 711 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 C20orf202A1L168 122 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 AGAP14A8MT82 685 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 SCN2BO60939 215 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 TPPPO94811 219 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 BMP8BP34820 402 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ZACNQ401N2 412 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 HSDL2Q6YN16 418 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 IFNL1Q8IU54 200 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 HS3ST5Q8IZT8 346 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 LIX1Q8N485 282 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 PGLYRP2Q96PD5 576 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ACOT13Q9NPJ3 140 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 OR6C75A6NL08 312 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 C9JVG2 144 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 PI15O43692 258 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ICMTO60725 284 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 SEC14L2O76054 403 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 THEGLP0DJG4 465 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 TLE2Q04725 743 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 GPR33Q49SQ1 333 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM31Q5JXX7 168 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ABCB8Q9NUT2 735 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 TTC34A8MYJ7 566 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 CSF1P09603 554 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 TPT1P13693 172 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 POU2F1P14859 743 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 PFKPQ01813 784 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ABHD11Q8NFV4 315 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 MROH1Q8NDA8 1641 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 TGOLN2O43493 480 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 DBIP07108 87 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 IL12BP29460 328 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 LCLAT1Q6UWP7 414 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC35G5Q96KT7 338 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 MUS81Q96NY9 551 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 MRIQ9BWK5 157 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 COQ3Q9NZJ6 369 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 SIRPGQ9P1W8 387 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 CDRT1O95170 752 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 BDNFP23560 247 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 HSD3B2P26439 372 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ATG4CQ96DT6 458 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 SDHAF3Q9NRP4 125 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 E2F3O00716 465 aa10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.1 ms