RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340074.9

UBE3B-201, Transcript of ubiquitin protein ligase E3B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE3B, Length 1,448 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3B-201ENST00000340074 DSG2Q14126 1118 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 TBCCQ15814 346 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 NKG7Q16617 165 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 SYT16Q17RD7 645 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 AMER3Q8N944 861 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 TRPV3Q8NET8 790 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 OR2Y1Q8NGV0 311 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 NT5CQ8TCD5 201 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 CREB3L4Q8TEY5 395 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 EFCAB11Q9BUY7 163 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 YIPF2Q9BWQ6 316 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 NT5DC2Q9H857 520 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 WDR54Q9H977 334 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 DCDC2Q9UHG0 476 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 PLAAQ9Y263 795 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 VSTM2BA6NLU5 285 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 SGK494L7N484 410 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 ERVH48-1M5A8F1 160 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 NSA2O95478 260 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 UMODP07911 640 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 GSTA1P08263 222 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 OTX2P32243 289 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 HNF4AP41235 474 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 CASP2P42575 452 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 PCDH1Q08174 1060 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 LAPTM5Q13571 262 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 E2F2Q14209 437 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 LINC00303Q3SY05 128 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 VWA2Q5GFL6 755 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 PAGE2BQ5JRK9 111 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 ADNP2Q6IQ32 1131 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 BORAQ6PGQ7 559 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 PDSS2Q86YH6 399 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 TTLQ8NG68 377 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 STT3BQ8TCJ2 826 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 SPSB2Q99619 263 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 SLC6A16Q9GZN6 736 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 KLHL31Q9H511 634 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 IPPKQ9H8X2 491 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 ANKHQ9HCJ1 492 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 TRPC4Q9UBN4 977 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 POLHQ9Y253 713 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 SLC22A7Q9Y694 548 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 ANKDD1BA6NHY2 528 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 A8MT66 165 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 H0YIG0 161 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 GLRA3O75311 464 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 B3GALT4O96024 378 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 SERPINA6P08185 405 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 ZGLP1P0C6A0 271 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 KRT4P19013 534 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 GSTM2P28161 218 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 PIK3CGP48736 1102 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 OCA2Q04671 838 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 SSPNQ14714 243 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 HERC3Q15034 1050 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 PCSK4Q6UW60 755 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 ABHD13Q7L211 337 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 VN1R5Q7Z5H4 357 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 PRSS58Q8IYP2 241 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 SHISA5Q8N114 240 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 THAP4Q8WY91 577 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 CCT6BQ92526 530 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 MIEF2Q96C03 454 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 AICDAQ9GZX7 198 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 PCTPQ9UKL6 214 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 EMCNQ9ULC0 261 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 KCNMB2Q9Y691 235 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE3B-201ENST00000340074 DOCK10Q96BY6 2186 aa14.46□□□□□ -0.1
UBE3B-201ENST00000340074 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
UBE3B-201ENST00000340074 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa14.45□□□□□ -0.1
UBE3B-201ENST00000340074 URADA6NGE7 173 aa14.45□□□□□ -0.1
UBE3B-201ENST00000340074 ZNF860A6NHJ4 632 aa14.45□□□□□ -0.1
UBE3B-201ENST00000340074 OR7A17O14581 309 aa14.45□□□□□ -0.1
UBE3B-201ENST00000340074 CLEC3AO75596 197 aa14.45□□□□□ -0.1
UBE3B-201ENST00000340074 KLHL18O94889 574 aa14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms