RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334490.5

C9orf47-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 47, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf47, Length 4,829 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47-201ENST00000334490 NFKBIDQ8NI38 313 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 NEK7Q8TDX7 302 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 RFKQ969G6 155 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 METTL7AQ9H8H3 244 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 GIN1Q9NXP7 522 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 DMTF1Q9Y222 760 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 E7ENX8 843 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 FHP07954 510 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 PEX2P28328 305 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 UNC50Q53HI1 259 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 CSNK1A1LQ8N752 337 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 TMEM74Q96NL1 305 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 F2RL3Q96RI0 385 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 FAM192AQ9GZU8 254 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 ZBTB26Q9HCK0 441 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 DAPK2Q9UIK4 370 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 HCN2Q9UL51 889 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 ARPC2O15144 300 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 ZNF823P16415 610 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 GMPRP36959 345 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 KCNC1P48547 511 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 XKP51811 444 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 CLDN2P57739 230 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 ABHD18Q0P651 414 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 ATP1A4Q13733 1029 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 PTGR1Q14914 329 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 ATCAYQ86WG3 371 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 GPR26Q8NDV2 337 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 KCNC2Q96PR1 638 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 MCM8Q9UJA3 840 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 WDR45Q9Y484 360 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 NUMBLQ9Y6R0 609 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 NOBOXO60393 691 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 KCNJ13O60928 360 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 PDYNP01213 254 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 CAPGP40121 348 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 RIPK1Q13546 671 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 ADGRE1Q14246 886 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 KRT77Q7Z794 578 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 C12orf40Q86WS4 652 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 NRROSQ86YC3 692 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 PLXDC1Q8IUK5 500 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 CANT1Q8WVQ1 401 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 MOCOSQ96EN8 888 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 TPK1Q9H3S4 243 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 A0A1B0GW55 424 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 PSMD11O00231 422 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 PGRMC2O15173 223 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 APBB3O95704 486 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 DUX4L2P0CJ85 424 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 DUX4L3P0CJ86 424 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 DUX4L4P0CJ87 422 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 DUX4L5P0CJ88 424 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 DUX4L6P0CJ89 424 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 DUX4L7P0CJ90 424 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 ANXA8P13928 327 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 IRS1P35568 1242 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 Q6ZSR6 202 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 GALNT7Q86SF2 657 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 MFSD6LQ8IWD5 586 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 RAB8BQ92930 207 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 GPER1Q99527 375 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 APOOQ9BUR5 198 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 ACTL8Q9H568 366 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 MCCC2Q9HCC0 563 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 DUX4Q9UBX2 424 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 AKAP11Q9UKA4 1901 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 SCN7AQ01118 1682 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 F11P03951 625 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 LINGO3P0C6S8 592 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 MATN1P21941 496 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 MTTPP55157 894 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 PPP1R3AQ16821 1122 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 RABL3Q5HYI8 236 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 FRRS1Q6ZNA5 592 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 SLC39A13Q96H72 371 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 SDHAF3Q9NRP4 125 aa14.49□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 FEZF1A0PJY2 475 aa14.48□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 MPZL2O60487 215 aa14.48□□□□□ -0.09
C9orf47-201ENST00000334490 TRAPPC6AO75865 159 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms