RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 CLIP3Q96DZ5 547 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC30A3Q99726 388 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 TRMOQ9BU70 441 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC29A3Q9BZD2 475 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 ALG9Q9H6U8 611 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC88CQ9P219 2028 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 KLK8O60259 260 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 SMIM24O75264 130 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 GSTM1P09488 218 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 MSH3P20585 1137 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 IMPDH1P20839 514 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 CDH3P22223 829 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNC1P48547 511 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 GSTM4Q03013 218 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 GBX1Q14549 363 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 ARMC6Q6NXE6 501 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM151BQ8IW70 566 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 L3HYPDHQ96EM0 354 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM8A1Q9UBU6 413 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 USH1CQ9Y6N9 552 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC35G4P0C7Q5 338 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 VARSP26640 1264 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 AKT1P31749 480 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 NAGLUP54802 743 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 MRGPREQ86SM8 312 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 TICAM1Q8IUC6 712 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 STON2Q8WXE9 905 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 C20orf27Q9GZN8 174 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 C5AR2Q9P296 337 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 ENO4A6NNW6 628 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 A8MT66 165 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 IQCF5A8MTL0 148 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 BTN3A1O00481 513 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 HCRTR1O43613 425 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 FTH1P02794 183 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 MTHFD2P13995 350 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 PVRP15151 417 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 AOAHP28039 575 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 NDUFS1P28331 727 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 PREPP48147 710 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 RCN2Q14257 317 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 CDKL4Q5MAI5 379 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 NAPRTQ6XQN6 538 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 NEK10Q6ZWH5 1172 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 CPNE9Q8IYJ1 553 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 LINGO1Q96FE5 620 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 SORT1Q99523 831 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 FANCEQ9HB96 536 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 NTNG1Q9Y2I2 539 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 KLHL33A6NCF5 533 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 MASP2O00187 686 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 ITM2AO43736 263 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP2A7P20853 494 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 PRLHRP49683 370 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 RRADP55042 308 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 OR4D1Q15615 310 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 IGFL3Q6UXB1 125 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 CYHR1Q6ZMK1 362 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 CFAP206Q8IYR0 622 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 C10orf82Q8WW14 230 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 KLHL25Q9H0H3 589 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 OR52A5Q9H2C5 316 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP10Q9P2G4 905 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 RAP2CQ9Y3L5 183 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 OTOGQ6ZRI0 2925 aa23.08■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 SLCO1B7G3V0H7 640 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 MATN2O00339 956 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 STX16O14662 325 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF749O43361 778 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 GABRA4P48169 554 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 DMTNQ08495 405 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 PRKAA1Q13131 559 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 MYO1HQ8N1T3 1032 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 HM13Q8TCT9 377 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 CCM2Q9BSQ5 444 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 SRMSQ9H3Y6 488 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNK13Q9HB14 408 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM60AQ9NP50 221 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF112Q9ULX5 631 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 HSPA4LO95757 839 aa23.06■■□□□ 1.28
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