RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768		E7ENQ6	273 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	TULP2	O00295	520 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	AREL1	O15033	823 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	DNAJB6	O75190	326 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	USP1	O94782	785 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	ZBED1	O96006	694 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	C9	P02748	559 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	UGT2B4	P06133	528 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	TNNI1	P19237	187 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	EPHA3	P29320	983 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	SLC7A1	P30825	629 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	ABCD1	P33897	745 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	KRT9	P35527	623 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	PRKAG1	P54619	331 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	TRPC3	Q13507	836 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	PSMD6	Q15008	389 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	NCF4	Q15080	339 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	INA	Q16352	499 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF699	Q32M78	642 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	PIGZ	Q86VD9	579 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	SPART	Q8N0X7	666 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	PELI3	Q8N2H9	469 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	RPRML	Q8N4K4	120 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	ASB5	Q8WWX0	329 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	PRR25	Q96S07	402 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	PSMB7	Q99436	277 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	DUSP16	Q9BY84	665 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	EXOC1	Q9NV70	894 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	SUFU	Q9UMX1	484 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF233	A6NK53	670 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768		F5H5T6	163 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	PSMD9	O00233	223 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	PDXK	O00764	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	PMPCB	O75439	489 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	TSPAN12	O95859	305 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	NR3C1	P04150	777 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	MYL1	P05976	194 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	IL4R	P24394	825 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	PRKAR1B	P31321	381 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	PRCP	P42785	496 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	PPP1CA	P62136	330 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	ADIG	Q0VDE8	80 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	MFAP5	Q13361	173 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	DENND2C	Q68D51	928 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	SFRP1	Q8N474	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	OR56A3	Q8NH54	315 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	GPR137	Q96N19	417 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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