RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592578.5

PSME3-215, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 4

Gene PSME3, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-215	ENST00000592578	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	LINGO1	Q96FE5	620 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	CFAP36	Q96G28	342 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	DRC3	Q9H069	523 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	GPAM	Q9HCL2	828 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	RNF14	Q9UBS8	474 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	C3orf18	Q9UK00	162 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	PDE10A	Q9Y233	779 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	MAP2K7	O14733	419 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	MLYCD	O95822	493 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	HP	P00738	406 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	CD99	P14209	185 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	ACPP	P15309	386 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	CCND1	P24385	295 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	TDGF1P3	P51864	188 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	ITGA8	P53708	1063 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	EMP2	P54851	167 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	CDKN2D	P55273	166 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	IL2	P60568	153 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	TBPL1	P62380	186 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	FAM53B	Q14153	422 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	GPATCH11	Q8N954	259 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	THAP11	Q96EK4	314 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	VWA7	Q9Y334	891 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	NDC80	O14777	642 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	TTI1	O43156	1089 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	FOXS1	O43638	330 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	ALOX12B	O75342	701 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	DRD2	P14416	443 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	CXCR2	P25025	360 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	SLC26A3	P40879	764 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	AVPR1B	P47901	424 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	ART1	P52961	327 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	ATG9B	Q674R7	924 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	STEAP4	Q687X5	459 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	C17orf64	Q86WR6	236 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	PLD3	Q8IV08	490 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	SNF8	Q96H20	258 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	PWWP2A	Q96N64	755 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	13.51	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	ABI3	Q9P2A4	366 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	FAM221A	A4D161	298 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	IDS	B3KWA1	339 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	P2RX6	O15547	441 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	RASAL1	O95294	804 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	HEXB	P07686	556 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	FDXR	P22570	491 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	GRK3	P35626	688 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	AP1S2	P56377	157 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	CSNK1G2	P78368	415 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	NAE1	Q13564	534 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PSME3-215	ENST00000592578	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25

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