RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 CD27P26842 260 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 TYK2P29597 1187 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 NNMTP40261 264 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 PLK1P53350 603 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 ST8SIA6P61647 398 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 ARF5P84085 180 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 IL9RQ01113 521 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 GNA12Q03113 381 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 CFHR1Q03591 330 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 ZBTB16Q05516 673 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 DPYSL2Q16555 572 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 SLC30A9Q6PML9 568 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 RHOUQ7L0Q8 258 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 NPWQ8N729 165 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 DCAF4L2Q8NA75 395 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM116Q8NCL8 245 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 OR2T3Q8NH03 318 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 HMCESQ96FZ2 354 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 SCPEP1Q9HB40 452 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 PRSS16Q9NQE7 514 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 ETNK2Q9NVF9 386 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 ARL15Q9NXU5 204 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 CAPN7Q9Y6W3 813 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 BSNQ9UPA5 3926 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 MYO1GB0I1T2 1018 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 CLIC1O00299 241 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 BUB1O43683 1085 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 RAMP2O60895 175 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 ZMPSTE24O75844 475 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 ERCC2P18074 760 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 TTKP33981 857 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 ACADVLP49748 655 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 VPS41P49754 854 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 CLK3P49761 638 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 CDH6P55285 790 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 C21orf59P57076 290 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 GSDMDP57764 484 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 KRT83P78385 493 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 SULT2A1Q06520 285 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 DPYSQ14117 519 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 KRT81Q14533 505 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 HADHQ16836 314 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 ACCSLQ4AC99 568 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 BOLA3Q53S33 107 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 HES3Q5TGS1 186 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 KLHL35Q6PF15 583 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 Q6ZNX1 250 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 STK40Q8N2I9 435 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 TEKT4Q8WW24 435 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 BIRC7Q96CA5 298 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 CSPG4P5Q96PW8 444 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 NCAPGQ9BPX3 1015 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 SGK2Q9HBY8 427 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 C20orf141Q9NUB4 165 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 ASIC5Q9NY37 505 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 TRIM10Q9UDY6 481 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 DTX4Q9Y2E6 619 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 COL12A1Q99715 3063 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 PLXNA2O75051 1894 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 A0A1B0GTQ1 180 aa7.5□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 A0A1W2PQ09 198 aa7.5□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 J3KR12 359 aa7.5□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 MASP2O00187 686 aa7.5□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 RNF103O00237 685 aa7.5□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 DFFAO00273 331 aa7.5□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 YKT6O15498 198 aa7.5□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 SPOPO43791 374 aa7.5□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 CD160O95971 181 aa7.5□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 TGM2P21980 687 aa7.5□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 IL4RP24394 825 aa7.5□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 GCH1P30793 250 aa7.5□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 FMO4P31512 558 aa7.5□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 ARHGAP25P42331 645 aa7.5□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 PSMD8P48556 350 aa7.5□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 MARCKSL1P49006 195 aa7.5□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 ARSEP51690 589 aa7.5□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 METAP1P53582 386 aa7.5□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 CLDN6P56747 220 aa7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms