RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 YIPF3Q9GZM5 350 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 TOR4AQ9NXH8 423 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 GPRC5BQ9NZH0 403 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1W2PR77 199 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 FADS2P1A8MWK0 482 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 LATO43561 262 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 CLPTM1O96005 669 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 ITGB7P26010 798 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 DGKQP52824 942 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 OR4D2P58180 307 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 PTGR1Q14914 329 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 SYTL3Q4VX76 610 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 DET1Q7L5Y6 550 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 IFNEQ86WN2 208 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 RIMKLAQ8IXN7 391 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 HM13Q8TCT9 377 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 RHBDD1Q8TEB9 315 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 OR8D1Q8WZ84 308 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 DTD2Q96FN9 168 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 ITCHQ96J02 903 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 PPM1MQ96MI6 270 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 FOPNLQ96NB1 174 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 HBEGFQ99075 208 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM8BA6NDV4 472 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 PLK4O00444 970 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 DKK1O94907 266 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 PRSS23O95084 383 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 RAP2AP10114 183 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 PFN3P60673 137 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 YBX1P67809 324 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 CYP4F3Q08477 520 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 ABRQ12979 859 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 NRF1Q16656 503 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 BORAQ6PGQ7 559 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 SUSD1Q6UWL2 747 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 DSG4Q86SJ6 1040 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC22A15Q8IZD6 547 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 OR2T12Q8NG77 320 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 AP2M1Q96CW1 435 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 BRF2Q9HAW0 419 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM220BPB1ANY3 271 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 H0YIV9 168 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 S100A3P33764 101 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 PPP2CBP62714 309 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 PPP2CAP67775 309 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 TUBA4AP68366 448 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 SPANXN4Q5MJ08 99 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM46CQ5VWP2 391 aa24.5■■□□□ 1.51
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CAPNS1-204ENST00000587718 OR56A3Q8NH54 315 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 OR52E6Q96RD3 313 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 VAPAQ9P0L0 249 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1B0GTQ1 180 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 SOCS2O14508 198 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 DFNA5O60443 496 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 PRPS1L1P21108 318 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 CD38P28907 300 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 TRPC1P48995 793 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 NR1H2P55055 460 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 DPTQ07507 201 aa24.5■■□□□ 1.51
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CAPNS1-204ENST00000587718 GRHL2Q6ISB3 625 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 EPHX4Q8IUS5 362 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 DTWD1Q8N5C7 304 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
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CAPNS1-204ENST00000587718 PPP1R16AQ96I34 528 aa24.5■■□□□ 1.51
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CAPNS1-204ENST00000587718 MAGIXQ9H6Y5 334 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 OLAHQ9NV23 265 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC22A14Q9Y267 594 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 TBC1D3EA0A087X179 549 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 ARHGEF33A8MVX0 844 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 TBC1D3LB9A6J9 549 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 ACOX3O15254 700 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 H6PDO95479 791 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 TBC1D3HP0C7X1 549 aa24.49■■□□□ 1.51
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