RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568232.1

CLK3-222, Transcript of CDC like kinase 3, human

Gene CLK3, Length 958 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK3-222	ENST00000568232	PINLYP	A6NC86	204 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	FAM166B	A8MTA8	275 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	HACD1	B0YJ81	288 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232		H7C0C1	242 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	SGK494	L7N484	410 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	SYT5	O00445	386 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	APOA4	P06727	396 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	CYC1	P08574	325 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	TACR1	P25103	407 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	AOAH	P28039	575 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	ATP5O	P48047	213 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	RHAG	Q02094	409 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	PRPSAP1	Q14558	356 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232		Q5PR19	223 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	LRRC38	Q5VT99	294 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	STYX	Q8WUJ0	223 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	CCDC138	Q96M89	665 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	DEPP	Q9NTK1	212 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232		H0YIG0	161 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	IL1RN	P18510	177 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	OR4D2	P58180	307 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	SEMA3A	Q14563	771 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	NDUFA9	Q16795	377 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	CCDC38	Q502W7	563 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	ZNF425	Q6IV72	752 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	PAOX	Q6QHF9	649 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232		Q96MF0	132 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	SMC6	Q96SB8	1091 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	CARD6	Q9BX69	1037 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	ANO10	Q9NW15	660 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232		A0A1B0GTH6	734 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232		A0A1W2PPR1	153 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	FEZF1	A0PJY2	475 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	MROH6	A6NGR9	719 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	TRIM64B	A6NI03	449 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	TXNDC9	O14530	226 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	HAT1	O14929	419 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	ARHGEF9	O43307	516 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	PHF2	O75151	1096 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	BCL6	P41182	706 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	NAA25	Q14CX7	972 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	POU4F3	Q15319	338 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	ADCK2	Q7Z695	626 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	LINC01560	Q8TB33	94 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	PEX11G	Q96HA9	241 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	SH3GL2	Q99962	352 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	LANCL2	Q9NS86	450 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	TAC3	Q9UHF0	121 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	HIVEP2	P31629	2446 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232		A0A0G2JMM0	328 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232		A0A1W2PPB8	328 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232		A0A1W2PRS3	328 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	CDK2AP1	O14519	115 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	FCHO1	O14526	889 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	RDH16	O75452	317 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	CRLF1	O75462	422 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CLK3-222	ENST00000568232	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	10.96	□□□□□ -0.65

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