RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 HERC3Q15034 1050 aa16.21■□□□□ 0.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 TGFBIQ15582 683 aa16.21■□□□□ 0.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 RELL1Q8IUW5 271 aa16.21■□□□□ 0.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM151BQ8IW70 566 aa16.21■□□□□ 0.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRSS58Q8IYP2 241 aa16.21■□□□□ 0.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR9A4Q8NGU2 314 aa16.21■□□□□ 0.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 FBF1Q8TES7 1133 aa16.21■□□□□ 0.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF592Q92610 1267 aa16.21■□□□□ 0.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 PNPLA2Q96AD5 504 aa16.21■□□□□ 0.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 RHBDF1Q96CC6 855 aa16.21■□□□□ 0.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 UBXN10Q96LJ8 280 aa16.21■□□□□ 0.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 AIF1LQ9BQI0 150 aa16.21■□□□□ 0.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 CAB39LQ9H9S4 337 aa16.21■□□□□ 0.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZFP69BQ9UJL9 534 aa16.21■□□□□ 0.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC22A14Q9Y267 594 aa16.21■□□□□ 0.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 CTAGE15A4D2H0 777 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 CTAGE8P0CG41 777 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 GNAZP19086 355 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 IL10P22301 178 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 CRABP2P29373 138 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 PHBP35232 272 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 GGT5P36269 586 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 SCTRP47872 440 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC6A12P48065 614 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 AP2B1P63010 937 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 REEP5Q00765 189 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 RGS1Q08116 209 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAPSNQ13702 412 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 COLEC12Q5KU26 742 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 CATSPEREQ5SY80 951 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 NXPE4Q6UWF7 544 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 NDUFAF7Q7L592 441 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 CTAGE6Q86UF2 777 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 LAPTM4BQ86VI4 370 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPSM1Q86YR5 675 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 CTAGE4Q8IX94 777 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRPV3Q8NET8 790 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 NT5CQ8TCD5 201 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 TSNARE1Q96NA8 513 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 LHPPQ9H008 270 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 NBASA2RRP1 2371 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC189A1A4V9 331 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 URADA6NGE7 173 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 TTLL8A6PVC2 850 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 NDUFS4O43181 175 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 BMP10O95393 424 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 CD1DP15813 335 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 IL1RNP18510 177 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 GSTM2P28161 218 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 CD97P48960 835 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 NADK2Q4G0N4 442 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC6A19Q695T7 634 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 SULT1C3Q6IMI6 304 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMPRSS11BQ86T26 416 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATCAYQ86WG3 371 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZADH2Q8N4Q0 377 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCT2Q8NC54 265 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 TTLQ8NG68 377 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR51Q1Q8NH59 317 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIF18AQ8NI77 898 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIAA1191Q96A73 305 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 MIB2Q96AX9 1013 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 SEC16BQ96JE7 1060 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 AGAP4Q96P64 663 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 CYTH2Q99418 400 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 RIC8BQ9NVN3 520 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPRC5BQ9NZH0 403 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 MKL2Q9ULH7 1088 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa16.18■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 KLHL18O94889 574 aa16.18■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 WDR47O94967 919 aa16.18■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 STATHP02808 62 aa16.18■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 COX6A1P12074 109 aa16.18■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 XCR1P46094 333 aa16.18■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDC16Q13042 620 aa16.18■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLMAPQ14BN4 828 aa16.18■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 SYT16Q17RD7 645 aa16.18■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM205Q6UW68 189 aa16.18■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGFL2Q6UWQ7 119 aa16.18■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa16.18■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAPH1Q70E73 1250 aa16.18■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABHD13Q7L211 337 aa16.18■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRSS41Q7RTY9 318 aa16.18■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms