RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566067.5

CENPT-222, Transcript of centromere protein T, human

TSL 3

Gene CENPT, Length 631 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CENPT-222	ENST00000566067	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	SQLE	Q14534	574 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	MAPRE2	Q15555	327 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	CYP2A13	Q16696	494 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	IMPG1	Q17R60	797 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	SMU1	Q2TAY7	513 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	LCTL	Q6UWM7	567 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	AVL9	Q8NBF6	648 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	SMPDL3A	Q92484	453 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	PYCR2	Q96C36	320 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	SGPP1	Q9BX95	441 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	GPR27	Q9NS67	375 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	TIMM22	Q9Y584	194 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067		E7ENX8	843 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	PRAMEF10	O60809	474 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	UNC5C	O95185	931 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	ERG	P11308	486 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	GNLY	P22749	145 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	CXCR2	P25025	360 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	CASP2	P42575	452 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	UQCRFS1	P47985	274 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	RAB28	P51157	221 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	MLLT10	P55197	1068 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	FOXA1	P55317	472 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	TBPL1	P62380	186 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	PHEX	P78562	749 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	TAP2	Q03519	686 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	KLRB1	Q12918	225 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	RPS6KA2	Q15349	733 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	RPE65	Q16518	533 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	GSTA3	Q16772	222 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	XKR6	Q5GH73	641 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	OGFOD2	Q6N063	350 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	CHSY3	Q70JA7	882 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	CATSPER2	Q96P56	530 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	CDK15	Q96Q40	435 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	KCNA7	Q96RP8	456 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	EHD1	Q9H4M9	534 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	ZNF225	Q9UK10	706 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	SERTM1	A2A2V5	107 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	MANBA	O00462	879 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	AQP9	O43315	295 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	CCNDBP1	O95273	360 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	DDAH2	O95865	285 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	LINC00032	P0C843	101 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	THRA	P10827	490 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	F3	P13726	295 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	HSD3B1	P14060	373 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	IDO1	P14902	403 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	HSD3B2	P26439	372 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	SHMT2	P34897	504 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	SCTR	P47872	440 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	KLF10	Q13118	480 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	FZD2	Q14332	565 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	HERC3	Q15034	1050 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CENPT-222	ENST00000566067	XKR7	Q5GH72	579 aa		13.4	□□□□□ -0.26

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