RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556321.1

PSMA3-210, Transcript of proteasome subunit alpha 3, human

TSL 2

Gene PSMA3, Length 500 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA3-210	ENST00000556321	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	GGN	Q86UU5	652 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	ANKRD46	Q86W74	232 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	TMEM219	Q86XT9	240 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	GPC2	Q8N158	579 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	RDM1	Q8NG50	284 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	TMEM186	Q96B77	213 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	SCMH1	Q96GD3	660 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	RASL10B	Q96S79	203 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	KRT23	Q9C075	422 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	SNX25	Q9H3E2	840 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	ITM2B	Q9Y287	266 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	COL4A5	P29400	1685 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	LAMB2	P55268	1798 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	CTAGE9	A4FU28	777 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321		E9PI62	339 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321		F8VVB4	439 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321		F8VWA3	439 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	RPS6KA5	O75582	802 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	PDE9A	O76083	593 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	IGHD	P01880	384 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	TFAP2A	P05549	437 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	LIPF	P07098	398 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	SBK2	P0C263	348 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	CTAGE8	P0CG41	777 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	CYP2A7	P20853	494 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	CBL	P22681	906 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	EPHX2	P34913	555 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	CDKN1A	P38936	164 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	GDF5	P43026	501 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	RGS19	P49795	217 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF131	P52739	623 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	MLLT10	P55197	1068 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	HSD17B7	P56937	341 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	ZXDA	P98168	799 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	SLC20A2	Q08357	652 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	TRAF2	Q12933	501 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	MFAP5	Q13361	173 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	GTF2H2	Q13888	395 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	NFATC4	Q14934	902 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	TWIST1	Q15672	202 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	STXBP2	Q15833	593 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	MTX3	Q5HYI7	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	PACS1	Q6VY07	963 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	TMEM19	Q96HH6	336 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	PKP2	Q99959	881 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	ACPT	Q9BZG2	426 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	GPR173	Q9NS66	373 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	POT1	Q9NUX5	634 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	KCNK6	Q9Y257	313 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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