RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 TUBA4AP68366 448 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CYP4F2P78329 520 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SHC2P98077 582 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC25A3Q00325 362 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SORDQ00796 357 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 LRRC63Q05C16 580 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 LGALS3BPQ08380 585 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 IFFO1Q0D2I5 559 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 FHL3Q13643 280 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 RAB11BQ15907 218 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SOWAHAQ2M3V2 549 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 HKDC1Q2TB90 917 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 GAGE13Q4V321 117 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 RABGAP1LQ5R372 815 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 C6orf141Q5SZD1 244 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF618Q5T7W0 954 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 IL23RQ5VWK5 629 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TTC23Q5W5X9 447 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM225Q6GV28 225 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 C1orf94Q6P1W5 598 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 PCSK4Q6UW60 755 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SYT10Q6XYQ8 523 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC16A9Q7RTY1 509 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 DCXRQ7Z4W1 244 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TSPAN33Q86UF1 283 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF575Q86XF7 245 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 LRRC34Q8IZ02 419 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 C1orf87Q8N0U7 546 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 KIAA0895Q8NCT3 520 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 BEND2Q8NDZ0 799 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CCDC26Q8TAB7 109 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 KCNG3Q8TAE7 436 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 DTX3LQ8TDB6 740 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CHPT1Q8WUD6 406 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM171Q8WVE6 324 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TANKQ92844 425 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 LENG9Q96B70 501 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SNF8Q96H20 258 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 MUS81Q96NY9 551 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TAAR6Q96RI8 345 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 NPY6RQ99463 290 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 NPAS2Q99743 824 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 C17orf62Q9BQA9 187 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM47Q9BQJ4 181 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CHRDL1Q9BU40 450 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 VN1R3Q9BXE9 311 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 IDI2Q9BXS1 227 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 DCLK3Q9C098 648 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 MFFQ9GZY8 342 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SIRPDQ9H106 197 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 GSTO2Q9H4Y5 243 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CXorf36Q9H7Y0 433 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF160Q9HCG1 818 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 MMP25Q9NPA2 562 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 DPP3Q9NY33 737 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TAS2R14Q9NYV8 317 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SENP1Q9P0U3 644 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ASIC3Q9UHC3 531 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 PSMD13Q9UNM6 376 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ABCC4O15439 1325 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TTC21AQ8NDW8 1320 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF541Q9H0D2 1346 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ADCY9O60503 1353 aa3.38□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 DISP3Q9P2K9 1392 aa3.38□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 A0A0U1RQV5 110 aa3.38□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ANKRD61A6NGH8 418 aa3.38□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 DUXAA6NLW8 204 aa3.38□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CENPBD1B2RD01 187 aa3.38□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 KLRF2D3W0D1 207 aa3.38□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 DSCR3O14972 297 aa3.38□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 RAD51BO15315 384 aa3.38□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 FLRT2O43155 660 aa3.38□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 HCN1O60741 890 aa3.38□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 RAMP2O60895 175 aa3.38□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ERN1O75460 977 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 STX11O75558 287 aa3.38□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CABYRO75952 493 aa3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.6 ms