RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549306.1

HECTD4-210, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 2

Gene HECTD4, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-210ENST00000549306 CNDP1Q96KN2 507 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 TMEM68Q96MH6 324 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 MXD3Q9BW11 206 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 DNAJC18Q9H819 358 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 KAT14Q9H8E8 782 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 ITM2CQ9NQX7 267 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 NUDT4Q9NZJ9 180 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 TMOD2Q9NZR1 351 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 FLRT3Q9NZU0 649 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 NYAP2Q9P242 653 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 CELA1Q9UNI1 258 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 WDR37Q9Y2I8 494 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 CNTNAP1P78357 1384 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 MYH8P13535 1937 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 LDLRAD4O15165 306 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 PLEKHA8P1O95397 391 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 IGHV3-13P01766 116 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 TPM1P09493 284 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 PDHBP11177 359 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 AKR1B1P15121 316 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 IL7RP16871 459 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 ITIH1P19827 911 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 MUTP22033 750 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 CALML3P27482 149 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 RDXP35241 583 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 THOP1P52888 689 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 UBE3AQ05086 875 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 DPYSQ14117 519 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 CCDC183Q5T5S1 534 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 WLSQ5T9L3 541 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 TMEM179Q6ZVK1 233 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 BTN2A1Q7KYR7 527 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 DNAJC22Q8N4W6 341 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 TTC39CQ8N584 583 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 GCSAMQ8N6F7 178 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 TRIML2Q8N7C3 387 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 SLC38A9Q8NBW4 561 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 LINC00301Q8NCQ3 95 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 CCDC148Q8NFR7 591 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 OR2T11Q8NH01 316 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 KCNG4Q8TDN1 519 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 FAM151AQ8WW52 585 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 PIBF1Q8WXW3 757 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 ATP6V1E2Q96A05 226 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 EXOC4Q96A65 974 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 EPSTI1Q96J88 318 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 NSMCE3Q96MG7 304 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 FNBP1Q96RU3 617 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 SLC26A6Q9BXS9 759 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 TEX13BQ9BXU2 312 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 HPS4Q9NQG7 708 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 ABCB10Q9NRK6 738 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 AIPL1Q9NZN9 384 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 COPG2Q9UBF2 871 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 MAD2L2Q9UI95 211 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 SLC7A7Q9UM01 511 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 STX8Q9UNK0 236 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 ZNF510Q9Y2H8 683 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 TRIM17Q9Y577 477 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 DGKBQ9Y6T7 804 aa3.39□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 MYH6P13533 1939 aa3.38□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 TCHHQ07283 1943 aa3.38□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 FAM170AA1A519 330 aa3.38□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 J3KRW8 73 aa3.38□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 SOCS3O14543 225 aa3.38□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 CYTH3O43739 400 aa3.38□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 PLOD3O60568 738 aa3.38□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 ZBED4O75132 1171 aa3.38□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 JRKO75564 520 aa3.38□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 KRTAP5-8O75690 187 aa3.38□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 NXPH2O95156 264 aa3.38□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa3.38□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 RPS2P15880 293 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 CKMT2P17540 419 aa3.38□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 KRT20P35900 424 aa3.38□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 RANBP1P43487 201 aa3.38□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 PRELPP51888 382 aa3.38□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 MNAT1P51948 309 aa3.38□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.4 ms