RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547216.1

ARHGAP9-208, Transcript of Rho GTPase activating protein 9, human

TSL 4

Gene ARHGAP9, Length 587 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216		A0A1W2PQM1	296 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	FEZF1	A0PJY2	475 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	FAM149A	A5PLN7	773 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TXNDC9	O14530	226 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	NDUFS4	O43181	175 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PRAMEF4	O60810	478 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CLEC3A	O75596	197 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PDYN	P01213	254 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SERPIND1	P05546	499 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	LINC00032	P0C843	101 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	BCL6	P41182	706 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	HTR6	P50406	440 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	RAP1GDS1	P52306	607 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CYP4F2	P78329	520 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TGM3	Q08188	693 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PHF19	Q5T6S3	580 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	NXN	Q6DKJ4	435 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	FCRL6	Q6DN72	434 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ASPG	Q86U10	573 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PLD3	Q8IV08	490 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	GATA6	Q92908	595 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TMEM74	Q96NL1	305 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	RHBG	Q9H310	441 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	MRGBP	Q9NV56	204 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PPT2	Q9UMR5	302 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216		A0A0J9YVX5	310 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SERTM1	A2A2V5	107 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	URAD	A6NGE7	173 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SNX3	O60493	162 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	MYO1D	O94832	1006 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	THRA	P10827	490 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	MAPK1	P28482	360 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	LSS	P48449	732 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SEPHS1	P49903	392 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	NEK2	P51955	445 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PWP1	Q13610	501 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SPIN4	Q56A73	249 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	XKR7	Q5GH72	579 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CGB2	Q6NT52	195 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	EPGN	Q6UW88	154 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CHSY3	Q70JA7	882 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PPM1M	Q96MI6	270 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	HBEGF	Q99075	208 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	AHSP	Q9NZD4	102 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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