RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541869.5

POLR1B-217, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR1B, Length 5,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-217ENST00000541869 LCTLQ6UWM7 567 aa9.97□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM139Q8IV31 216 aa9.97□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa9.97□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 RELTQ969Z4 430 aa9.97□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 DUSP26Q9BV47 211 aa9.97□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 MECRQ9BV79 373 aa9.97□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 ERVK-6Q9BXR3 956 aa9.97□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 POPDC3Q9HBV1 291 aa9.97□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 USP3Q9Y6I4 520 aa9.97□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF208O43345 1280 aa9.97□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 HCN1O60741 890 aa9.97□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 STATHP02808 62 aa9.97□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 SERPINA6P08185 405 aa9.97□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 IMPDH1P20839 514 aa9.97□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 CCNOP22674 350 aa9.97□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 IL12RB1P42701 662 aa9.97□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 GSTM5P46439 218 aa9.97□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 RHAGQ02094 409 aa9.97□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 TGFBR3Q03167 851 aa9.97□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 DEFB134Q4QY38 66 aa9.97□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 UNC5DQ6UXZ4 953 aa9.97□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 DPPA4Q7L190 304 aa9.97□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 MFSD2AQ8NA29 543 aa9.97□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 DNAJB8Q8NHS0 232 aa9.97□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa9.97□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 GRIP2Q9C0E4 1043 aa9.97□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 CYTH4Q9UIA0 394 aa9.97□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa9.97□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 DRGXA6NNA5 263 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 GSC2O15499 205 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 NRP2O60462 931 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 RFPL3O75679 317 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 CDH1P12830 882 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 PRPS1L1P21108 318 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 RORAP35398 523 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 VHLP40337 213 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 GRIA1P42261 906 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 UCNP55089 124 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 RAPSNQ13702 412 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 KCNJ11Q14654 390 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 TCEAL1Q15170 157 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 RCN1Q15293 331 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 EML3Q32P44 896 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 TSSK4Q6SA08 328 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 RBP7Q96R05 134 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 KATNBL1Q9H079 304 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 SLC17A7Q9P2U7 560 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 PCDHB10Q9UN67 800 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 DHRS7Q9Y394 339 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 ANPEPP15144 967 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 DNAJB1P25685 340 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 CD47Q08722 323 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 LEXMQ3ZCV2 418 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 CLEC6AQ6EIG7 209 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 GK5Q6ZS86 529 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 CPNE8Q86YQ8 564 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 SLC30A8Q8IWU4 369 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF671Q8TAW3 534 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 SLCO2A1Q92959 643 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 RANBP9Q96S59 729 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 MTG2Q9H4K7 406 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 FAM86C1Q9NVL1 165 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 ASB6Q9NWX5 421 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 MARK1Q9P0L2 795 aa9.96□□□□□ -0.81
POLR1B-217ENST00000541869 SLC6A9P48067 706 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF84P51523 738 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 DIO3P55073 304 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 GSCP56915 257 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 SRYQ05066 204 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 TDRPQ86YL5 185 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 MUCL1Q96DR8 90 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 TRIB3Q96RU7 358 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 IL1RAPQ9NPH3 570 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 POT1Q9NUX5 634 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 CPNE7Q9UBL6 633 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 A0A0J9YY10 115 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 MAGEB17A8MXT2 336 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 TRIM38O00635 465 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 ASNA1O43681 348 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 UBOX5O94941 541 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 TPOP07202 933 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 CSNK1DP48730 415 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 WNT7BP56706 349 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF423Q2M1K9 1284 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 CATSPEREQ5SY80 951 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 SUSD1Q6UWL2 747 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 NRROSQ86YC3 692 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 OR56A1Q8NGH5 318 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 MRGPRX2Q96LB1 330 aa9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms